Protein–RNA interactions for Protein: Q17R55

FAM187B, Protein FAM187B, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM187BQ17R55 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FAM187BQ17R55 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FAM187BQ17R55 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FAM187BQ17R55 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
FAM187BQ17R55 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FAM187BQ17R55 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FAM187BQ17R55 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FAM187BQ17R55 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FAM187BQ17R55 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FAM187BQ17R55 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FAM187BQ17R55 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FAM187BQ17R55 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FAM187BQ17R55 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FAM187BQ17R55 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FAM187BQ17R55 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FAM187BQ17R55 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FAM187BQ17R55 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FAM187BQ17R55 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FAM187BQ17R55 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FAM187BQ17R55 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FAM187BQ17R55 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FAM187BQ17R55 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FAM187BQ17R55 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FAM187BQ17R55 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FAM187BQ17R55 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FAM187BQ17R55 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FAM187BQ17R55 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FAM187BQ17R55 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FAM187BQ17R55 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FAM187BQ17R55 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FAM187BQ17R55 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FAM187BQ17R55 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FAM187BQ17R55 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FAM187BQ17R55 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FAM187BQ17R55 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FAM187BQ17R55 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
FAM187BQ17R55 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FAM187BQ17R55 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FAM187BQ17R55 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FAM187BQ17R55 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FAM187BQ17R55 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FAM187BQ17R55 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FAM187BQ17R55 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FAM187BQ17R55 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
FAM187BQ17R55 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FAM187BQ17R55 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FAM187BQ17R55 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FAM187BQ17R55 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FAM187BQ17R55 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FAM187BQ17R55 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FAM187BQ17R55 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FAM187BQ17R55 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FAM187BQ17R55 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FAM187BQ17R55 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FAM187BQ17R55 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FAM187BQ17R55 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FAM187BQ17R55 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FAM187BQ17R55 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FAM187BQ17R55 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FAM187BQ17R55 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FAM187BQ17R55 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FAM187BQ17R55 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FAM187BQ17R55 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FAM187BQ17R55 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FAM187BQ17R55 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FAM187BQ17R55 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FAM187BQ17R55 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FAM187BQ17R55 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FAM187BQ17R55 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FAM187BQ17R55 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
FAM187BQ17R55 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
FAM187BQ17R55 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
FAM187BQ17R55 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FAM187BQ17R55 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FAM187BQ17R55 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
FAM187BQ17R55 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FAM187BQ17R55 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FAM187BQ17R55 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FAM187BQ17R55 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FAM187BQ17R55 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FAM187BQ17R55 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FAM187BQ17R55 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FAM187BQ17R55 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FAM187BQ17R55 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FAM187BQ17R55 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FAM187BQ17R55 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FAM187BQ17R55 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FAM187BQ17R55 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FAM187BQ17R55 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FAM187BQ17R55 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FAM187BQ17R55 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FAM187BQ17R55 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FAM187BQ17R55 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FAM187BQ17R55 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FAM187BQ17R55 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
FAM187BQ17R55 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
FAM187BQ17R55 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FAM187BQ17R55 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FAM187BQ17R55 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FAM187BQ17R55 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms