Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

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Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PDK4Q16654 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PDK4Q16654 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PDK4Q16654 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PDK4Q16654 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PDK4Q16654 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PDK4Q16654 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PDK4Q16654 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PDK4Q16654 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PDK4Q16654 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PDK4Q16654 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PDK4Q16654 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PDK4Q16654 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PDK4Q16654 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PDK4Q16654 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PDK4Q16654 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PDK4Q16654 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PDK4Q16654 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PDK4Q16654 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PDK4Q16654 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PDK4Q16654 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PDK4Q16654 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PDK4Q16654 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PDK4Q16654 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PDK4Q16654 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PDK4Q16654 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PDK4Q16654 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PDK4Q16654 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PDK4Q16654 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PDK4Q16654 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PDK4Q16654 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PDK4Q16654 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PDK4Q16654 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PDK4Q16654 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PDK4Q16654 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PDK4Q16654 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PDK4Q16654 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PDK4Q16654 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PDK4Q16654 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PDK4Q16654 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PDK4Q16654 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PDK4Q16654 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PDK4Q16654 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PDK4Q16654 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PDK4Q16654 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PDK4Q16654 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PDK4Q16654 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PDK4Q16654 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PDK4Q16654 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PDK4Q16654 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PDK4Q16654 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PDK4Q16654 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PDK4Q16654 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PDK4Q16654 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PDK4Q16654 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PDK4Q16654 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PDK4Q16654 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PDK4Q16654 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PDK4Q16654 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PDK4Q16654 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PDK4Q16654 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PDK4Q16654 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PDK4Q16654 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PDK4Q16654 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PDK4Q16654 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PDK4Q16654 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PDK4Q16654 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PDK4Q16654 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PDK4Q16654 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PDK4Q16654 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PDK4Q16654 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PDK4Q16654 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PDK4Q16654 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PDK4Q16654 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PDK4Q16654 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PDK4Q16654 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PDK4Q16654 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PDK4Q16654 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PDK4Q16654 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PDK4Q16654 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PDK4Q16654 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PDK4Q16654 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PDK4Q16654 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PDK4Q16654 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PDK4Q16654 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PDK4Q16654 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PDK4Q16654 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PDK4Q16654 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PDK4Q16654 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PDK4Q16654 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PDK4Q16654 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PDK4Q16654 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PDK4Q16654 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PDK4Q16654 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PDK4Q16654 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PDK4Q16654 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PDK4Q16654 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PDK4Q16654 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PDK4Q16654 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PDK4Q16654 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
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