Protein–RNA interactions for Protein: Q16620

NTRK2, BDNF/NT-3 growth factors receptor, humanhuman

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK2Q16620 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NTRK2Q16620 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NTRK2Q16620 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NTRK2Q16620 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NTRK2Q16620 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NTRK2Q16620 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NTRK2Q16620 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NTRK2Q16620 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NTRK2Q16620 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NTRK2Q16620 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NTRK2Q16620 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NTRK2Q16620 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NTRK2Q16620 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NTRK2Q16620 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NTRK2Q16620 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NTRK2Q16620 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NTRK2Q16620 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NTRK2Q16620 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NTRK2Q16620 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NTRK2Q16620 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NTRK2Q16620 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NTRK2Q16620 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NTRK2Q16620 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NTRK2Q16620 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NTRK2Q16620 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NTRK2Q16620 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NTRK2Q16620 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NTRK2Q16620 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NTRK2Q16620 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NTRK2Q16620 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NTRK2Q16620 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NTRK2Q16620 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NTRK2Q16620 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NTRK2Q16620 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NTRK2Q16620 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NTRK2Q16620 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NTRK2Q16620 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NTRK2Q16620 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NTRK2Q16620 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NTRK2Q16620 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NTRK2Q16620 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NTRK2Q16620 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NTRK2Q16620 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NTRK2Q16620 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NTRK2Q16620 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NTRK2Q16620 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NTRK2Q16620 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NTRK2Q16620 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NTRK2Q16620 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NTRK2Q16620 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NTRK2Q16620 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NTRK2Q16620 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NTRK2Q16620 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NTRK2Q16620 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NTRK2Q16620 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NTRK2Q16620 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NTRK2Q16620 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NTRK2Q16620 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NTRK2Q16620 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NTRK2Q16620 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NTRK2Q16620 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NTRK2Q16620 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NTRK2Q16620 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NTRK2Q16620 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NTRK2Q16620 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NTRK2Q16620 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NTRK2Q16620 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NTRK2Q16620 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NTRK2Q16620 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NTRK2Q16620 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NTRK2Q16620 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NTRK2Q16620 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NTRK2Q16620 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NTRK2Q16620 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NTRK2Q16620 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NTRK2Q16620 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NTRK2Q16620 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NTRK2Q16620 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NTRK2Q16620 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NTRK2Q16620 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NTRK2Q16620 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NTRK2Q16620 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NTRK2Q16620 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NTRK2Q16620 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NTRK2Q16620 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NTRK2Q16620 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NTRK2Q16620 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NTRK2Q16620 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NTRK2Q16620 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NTRK2Q16620 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NTRK2Q16620 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NTRK2Q16620 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
NTRK2Q16620 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NTRK2Q16620 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms