Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
FXNQ16595 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FXNQ16595 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FXNQ16595 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FXNQ16595 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FXNQ16595 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FXNQ16595 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FXNQ16595 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FXNQ16595 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FXNQ16595 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FXNQ16595 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FXNQ16595 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FXNQ16595 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FXNQ16595 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FXNQ16595 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FXNQ16595 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FXNQ16595 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FXNQ16595 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FXNQ16595 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FXNQ16595 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FXNQ16595 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FXNQ16595 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FXNQ16595 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FXNQ16595 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FXNQ16595 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FXNQ16595 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FXNQ16595 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
FXNQ16595 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FXNQ16595 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FXNQ16595 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
FXNQ16595 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FXNQ16595 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
FXNQ16595 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FXNQ16595 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FXNQ16595 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FXNQ16595 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FXNQ16595 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FXNQ16595 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FXNQ16595 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FXNQ16595 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FXNQ16595 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FXNQ16595 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FXNQ16595 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FXNQ16595 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FXNQ16595 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FXNQ16595 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FXNQ16595 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FXNQ16595 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FXNQ16595 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FXNQ16595 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FXNQ16595 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FXNQ16595 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FXNQ16595 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FXNQ16595 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FXNQ16595 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FXNQ16595 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FXNQ16595 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FXNQ16595 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FXNQ16595 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FXNQ16595 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FXNQ16595 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FXNQ16595 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FXNQ16595 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FXNQ16595 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FXNQ16595 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FXNQ16595 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FXNQ16595 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FXNQ16595 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FXNQ16595 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FXNQ16595 LINC00887-202ENST00000414120 2880 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FXNQ16595 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FXNQ16595 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FXNQ16595 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FXNQ16595 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FXNQ16595 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FXNQ16595 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FXNQ16595 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FXNQ16595 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FXNQ16595 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FXNQ16595 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FXNQ16595 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FXNQ16595 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
FXNQ16595 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FXNQ16595 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FXNQ16595 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FXNQ16595 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FXNQ16595 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FXNQ16595 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FXNQ16595 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FXNQ16595 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
FXNQ16595 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FXNQ16595 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FXNQ16595 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FXNQ16595 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FXNQ16595 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FXNQ16595 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FXNQ16595 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FXNQ16595 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FXNQ16595 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FXNQ16595 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms