Protein–RNA interactions for Protein: Q16549

PCSK7, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 7, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK7Q16549 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PCSK7Q16549 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PCSK7Q16549 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
PCSK7Q16549 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PCSK7Q16549 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PCSK7Q16549 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PCSK7Q16549 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PCSK7Q16549 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PCSK7Q16549 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PCSK7Q16549 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PCSK7Q16549 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PCSK7Q16549 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PCSK7Q16549 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PCSK7Q16549 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PCSK7Q16549 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PCSK7Q16549 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PCSK7Q16549 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PCSK7Q16549 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PCSK7Q16549 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PCSK7Q16549 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PCSK7Q16549 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PCSK7Q16549 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PCSK7Q16549 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PCSK7Q16549 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PCSK7Q16549 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PCSK7Q16549 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PCSK7Q16549 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PCSK7Q16549 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PCSK7Q16549 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PCSK7Q16549 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PCSK7Q16549 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PCSK7Q16549 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PCSK7Q16549 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
PCSK7Q16549 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PCSK7Q16549 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PCSK7Q16549 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
PCSK7Q16549 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PCSK7Q16549 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PCSK7Q16549 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PCSK7Q16549 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PCSK7Q16549 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PCSK7Q16549 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PCSK7Q16549 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PCSK7Q16549 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PCSK7Q16549 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PCSK7Q16549 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PCSK7Q16549 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PCSK7Q16549 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PCSK7Q16549 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PCSK7Q16549 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PCSK7Q16549 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PCSK7Q16549 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PCSK7Q16549 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PCSK7Q16549 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PCSK7Q16549 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PCSK7Q16549 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PCSK7Q16549 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PCSK7Q16549 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PCSK7Q16549 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PCSK7Q16549 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PCSK7Q16549 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PCSK7Q16549 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PCSK7Q16549 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PCSK7Q16549 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PCSK7Q16549 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PCSK7Q16549 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PCSK7Q16549 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PCSK7Q16549 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PCSK7Q16549 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PCSK7Q16549 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PCSK7Q16549 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PCSK7Q16549 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
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PCSK7Q16549 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PCSK7Q16549 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PCSK7Q16549 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PCSK7Q16549 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PCSK7Q16549 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
PCSK7Q16549 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PCSK7Q16549 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PCSK7Q16549 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PCSK7Q16549 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
PCSK7Q16549 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PCSK7Q16549 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PCSK7Q16549 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PCSK7Q16549 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PCSK7Q16549 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PCSK7Q16549 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PCSK7Q16549 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PCSK7Q16549 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PCSK7Q16549 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PCSK7Q16549 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PCSK7Q16549 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PCSK7Q16549 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PCSK7Q16549 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
PCSK7Q16549 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PCSK7Q16549 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PCSK7Q16549 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
PCSK7Q16549 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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