Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
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