Protein–RNA interactions for Protein: Q16288

NTRK3, NT-3 growth factor receptor, humanhuman

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Length 839 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK3Q16288 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NTRK3Q16288 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NTRK3Q16288 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NTRK3Q16288 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NTRK3Q16288 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NTRK3Q16288 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
NTRK3Q16288 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
NTRK3Q16288 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NTRK3Q16288 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NTRK3Q16288 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NTRK3Q16288 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
NTRK3Q16288 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
NTRK3Q16288 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NTRK3Q16288 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NTRK3Q16288 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NTRK3Q16288 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NTRK3Q16288 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
NTRK3Q16288 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NTRK3Q16288 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
NTRK3Q16288 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NTRK3Q16288 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
NTRK3Q16288 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
NTRK3Q16288 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NTRK3Q16288 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NTRK3Q16288 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NTRK3Q16288 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NTRK3Q16288 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NTRK3Q16288 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
NTRK3Q16288 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NTRK3Q16288 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NTRK3Q16288 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NTRK3Q16288 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NTRK3Q16288 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NTRK3Q16288 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NTRK3Q16288 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NTRK3Q16288 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NTRK3Q16288 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NTRK3Q16288 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NTRK3Q16288 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NTRK3Q16288 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NTRK3Q16288 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NTRK3Q16288 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NTRK3Q16288 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NTRK3Q16288 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NTRK3Q16288 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NTRK3Q16288 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
NTRK3Q16288 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NTRK3Q16288 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NTRK3Q16288 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NTRK3Q16288 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
NTRK3Q16288 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NTRK3Q16288 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NTRK3Q16288 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NTRK3Q16288 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NTRK3Q16288 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NTRK3Q16288 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NTRK3Q16288 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NTRK3Q16288 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NTRK3Q16288 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NTRK3Q16288 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NTRK3Q16288 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NTRK3Q16288 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NTRK3Q16288 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NTRK3Q16288 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NTRK3Q16288 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NTRK3Q16288 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NTRK3Q16288 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NTRK3Q16288 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NTRK3Q16288 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NTRK3Q16288 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NTRK3Q16288 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NTRK3Q16288 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NTRK3Q16288 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NTRK3Q16288 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NTRK3Q16288 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NTRK3Q16288 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NTRK3Q16288 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NTRK3Q16288 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NTRK3Q16288 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NTRK3Q16288 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NTRK3Q16288 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NTRK3Q16288 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NTRK3Q16288 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
NTRK3Q16288 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NTRK3Q16288 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NTRK3Q16288 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NTRK3Q16288 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NTRK3Q16288 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NTRK3Q16288 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NTRK3Q16288 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NTRK3Q16288 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NTRK3Q16288 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NTRK3Q16288 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NTRK3Q16288 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NTRK3Q16288 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NTRK3Q16288 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NTRK3Q16288 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
NTRK3Q16288 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NTRK3Q16288 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NTRK3Q16288 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
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