Protein–RNA interactions for Protein: Q16048

PMCHL1, Putative pro-MCH-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 86 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMCHL1Q16048 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
PMCHL1Q16048 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
PMCHL1Q16048 PTPN23-201ENST00000265562 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
PMCHL1Q16048 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
PMCHL1Q16048 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
PMCHL1Q16048 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
PMCHL1Q16048 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
PMCHL1Q16048 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
PMCHL1Q16048 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
PMCHL1Q16048 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
PMCHL1Q16048 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PMCHL1Q16048 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PMCHL1Q16048 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PMCHL1Q16048 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PMCHL1Q16048 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PMCHL1Q16048 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PMCHL1Q16048 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PMCHL1Q16048 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PMCHL1Q16048 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
PMCHL1Q16048 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
PMCHL1Q16048 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
PMCHL1Q16048 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PMCHL1Q16048 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC12.2□□□□□ -0.46
PMCHL1Q16048 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
PMCHL1Q16048 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PMCHL1Q16048 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PMCHL1Q16048 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PMCHL1Q16048 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PMCHL1Q16048 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PMCHL1Q16048 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PMCHL1Q16048 RBFADN-204ENST00000568911 5187 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
PMCHL1Q16048 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
PMCHL1Q16048 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
PMCHL1Q16048 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
PMCHL1Q16048 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
PMCHL1Q16048 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
PMCHL1Q16048 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
PMCHL1Q16048 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PMCHL1Q16048 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PMCHL1Q16048 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
PMCHL1Q16048 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
PMCHL1Q16048 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
PMCHL1Q16048 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
PMCHL1Q16048 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
PMCHL1Q16048 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PMCHL1Q16048 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PMCHL1Q16048 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PMCHL1Q16048 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PMCHL1Q16048 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
PMCHL1Q16048 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PMCHL1Q16048 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PMCHL1Q16048 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PMCHL1Q16048 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
PMCHL1Q16048 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PMCHL1Q16048 CFLAR-206ENST00000395148 4415 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PMCHL1Q16048 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PMCHL1Q16048 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
PMCHL1Q16048 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
PMCHL1Q16048 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PMCHL1Q16048 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
PMCHL1Q16048 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
PMCHL1Q16048 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PMCHL1Q16048 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PMCHL1Q16048 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PMCHL1Q16048 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PMCHL1Q16048 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
PMCHL1Q16048 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PMCHL1Q16048 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PMCHL1Q16048 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
PMCHL1Q16048 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
PMCHL1Q16048 TRIO-202ENST00000344204 11100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PMCHL1Q16048 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
PMCHL1Q16048 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PMCHL1Q16048 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PMCHL1Q16048 ZC3HAV1-203ENST00000464606 4776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
PMCHL1Q16048 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC12.19□□□□□ -0.46
PMCHL1Q16048 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
PMCHL1Q16048 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PMCHL1Q16048 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PMCHL1Q16048 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
PMCHL1Q16048 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PMCHL1Q16048 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PMCHL1Q16048 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
PMCHL1Q16048 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
PMCHL1Q16048 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PMCHL1Q16048 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PMCHL1Q16048 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PMCHL1Q16048 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PMCHL1Q16048 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PMCHL1Q16048 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PMCHL1Q16048 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
PMCHL1Q16048 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
PMCHL1Q16048 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
PMCHL1Q16048 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
PMCHL1Q16048 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
PMCHL1Q16048 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
PMCHL1Q16048 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
PMCHL1Q16048 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
PMCHL1Q16048 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
PMCHL1Q16048 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms