Protein–RNA interactions for Protein: Q15915

ZIC1, Zinc finger protein ZIC 1, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC1Q15915 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZIC1Q15915 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZIC1Q15915 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZIC1Q15915 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZIC1Q15915 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ZIC1Q15915 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ZIC1Q15915 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZIC1Q15915 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZIC1Q15915 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZIC1Q15915 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZIC1Q15915 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZIC1Q15915 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZIC1Q15915 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZIC1Q15915 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZIC1Q15915 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZIC1Q15915 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZIC1Q15915 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZIC1Q15915 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZIC1Q15915 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZIC1Q15915 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZIC1Q15915 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZIC1Q15915 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZIC1Q15915 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZIC1Q15915 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZIC1Q15915 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZIC1Q15915 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZIC1Q15915 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZIC1Q15915 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZIC1Q15915 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZIC1Q15915 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZIC1Q15915 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZIC1Q15915 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZIC1Q15915 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZIC1Q15915 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZIC1Q15915 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZIC1Q15915 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZIC1Q15915 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZIC1Q15915 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZIC1Q15915 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZIC1Q15915 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZIC1Q15915 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZIC1Q15915 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZIC1Q15915 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZIC1Q15915 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ZIC1Q15915 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZIC1Q15915 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZIC1Q15915 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZIC1Q15915 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ZIC1Q15915 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZIC1Q15915 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZIC1Q15915 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZIC1Q15915 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ZIC1Q15915 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ZIC1Q15915 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZIC1Q15915 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZIC1Q15915 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZIC1Q15915 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZIC1Q15915 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZIC1Q15915 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZIC1Q15915 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZIC1Q15915 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZIC1Q15915 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZIC1Q15915 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZIC1Q15915 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZIC1Q15915 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ZIC1Q15915 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZIC1Q15915 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZIC1Q15915 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZIC1Q15915 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZIC1Q15915 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZIC1Q15915 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZIC1Q15915 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZIC1Q15915 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZIC1Q15915 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZIC1Q15915 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZIC1Q15915 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZIC1Q15915 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ZIC1Q15915 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZIC1Q15915 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZIC1Q15915 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZIC1Q15915 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZIC1Q15915 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZIC1Q15915 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZIC1Q15915 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ZIC1Q15915 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZIC1Q15915 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZIC1Q15915 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ZIC1Q15915 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZIC1Q15915 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZIC1Q15915 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZIC1Q15915 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZIC1Q15915 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZIC1Q15915 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZIC1Q15915 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZIC1Q15915 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZIC1Q15915 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZIC1Q15915 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZIC1Q15915 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZIC1Q15915 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZIC1Q15915 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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