Protein–RNA interactions for Protein: Q15825

CHRNA6, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA6Q15825 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHRNA6Q15825 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHRNA6Q15825 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHRNA6Q15825 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHRNA6Q15825 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHRNA6Q15825 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHRNA6Q15825 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHRNA6Q15825 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHRNA6Q15825 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHRNA6Q15825 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHRNA6Q15825 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHRNA6Q15825 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHRNA6Q15825 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHRNA6Q15825 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHRNA6Q15825 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHRNA6Q15825 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CHRNA6Q15825 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHRNA6Q15825 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHRNA6Q15825 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHRNA6Q15825 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHRNA6Q15825 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHRNA6Q15825 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CHRNA6Q15825 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHRNA6Q15825 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHRNA6Q15825 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHRNA6Q15825 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHRNA6Q15825 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHRNA6Q15825 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHRNA6Q15825 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHRNA6Q15825 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHRNA6Q15825 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHRNA6Q15825 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHRNA6Q15825 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHRNA6Q15825 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CHRNA6Q15825 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CHRNA6Q15825 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHRNA6Q15825 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHRNA6Q15825 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHRNA6Q15825 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHRNA6Q15825 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHRNA6Q15825 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHRNA6Q15825 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHRNA6Q15825 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHRNA6Q15825 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHRNA6Q15825 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHRNA6Q15825 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CHRNA6Q15825 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHRNA6Q15825 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHRNA6Q15825 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHRNA6Q15825 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHRNA6Q15825 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHRNA6Q15825 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHRNA6Q15825 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHRNA6Q15825 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHRNA6Q15825 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHRNA6Q15825 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHRNA6Q15825 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHRNA6Q15825 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHRNA6Q15825 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHRNA6Q15825 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHRNA6Q15825 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHRNA6Q15825 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHRNA6Q15825 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHRNA6Q15825 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CHRNA6Q15825 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHRNA6Q15825 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNA6Q15825 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNA6Q15825 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNA6Q15825 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNA6Q15825 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNA6Q15825 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNA6Q15825 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNA6Q15825 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNA6Q15825 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNA6Q15825 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNA6Q15825 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNA6Q15825 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNA6Q15825 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNA6Q15825 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNA6Q15825 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNA6Q15825 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNA6Q15825 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNA6Q15825 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNA6Q15825 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNA6Q15825 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNA6Q15825 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNA6Q15825 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNA6Q15825 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNA6Q15825 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNA6Q15825 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNA6Q15825 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNA6Q15825 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNA6Q15825 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNA6Q15825 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNA6Q15825 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNA6Q15825 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNA6Q15825 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNA6Q15825 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNA6Q15825 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNA6Q15825 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
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