Protein–RNA interactions for Protein: Q15517

CDSN, Corneodesmosin, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDSNQ15517 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CDSNQ15517 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CDSNQ15517 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
CDSNQ15517 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CDSNQ15517 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CDSNQ15517 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CDSNQ15517 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CDSNQ15517 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CDSNQ15517 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CDSNQ15517 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CDSNQ15517 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CDSNQ15517 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CDSNQ15517 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
CDSNQ15517 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CDSNQ15517 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CDSNQ15517 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CDSNQ15517 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CDSNQ15517 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CDSNQ15517 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CDSNQ15517 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
CDSNQ15517 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CDSNQ15517 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
CDSNQ15517 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CDSNQ15517 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
CDSNQ15517 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CDSNQ15517 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CDSNQ15517 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CDSNQ15517 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CDSNQ15517 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CDSNQ15517 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
CDSNQ15517 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CDSNQ15517 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CDSNQ15517 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
CDSNQ15517 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
CDSNQ15517 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CDSNQ15517 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CDSNQ15517 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CDSNQ15517 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CDSNQ15517 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CDSNQ15517 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CDSNQ15517 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CDSNQ15517 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
CDSNQ15517 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CDSNQ15517 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CDSNQ15517 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.15
CDSNQ15517 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CDSNQ15517 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CDSNQ15517 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CDSNQ15517 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CDSNQ15517 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CDSNQ15517 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CDSNQ15517 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CDSNQ15517 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CDSNQ15517 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CDSNQ15517 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
CDSNQ15517 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CDSNQ15517 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CDSNQ15517 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CDSNQ15517 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CDSNQ15517 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
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CDSNQ15517 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CDSNQ15517 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CDSNQ15517 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CDSNQ15517 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
CDSNQ15517 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CDSNQ15517 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CDSNQ15517 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
CDSNQ15517 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CDSNQ15517 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CDSNQ15517 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CDSNQ15517 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CDSNQ15517 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CDSNQ15517 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CDSNQ15517 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CDSNQ15517 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CDSNQ15517 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CDSNQ15517 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CDSNQ15517 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CDSNQ15517 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CDSNQ15517 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CDSNQ15517 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CDSNQ15517 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CDSNQ15517 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CDSNQ15517 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CDSNQ15517 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CDSNQ15517 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CDSNQ15517 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CDSNQ15517 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CDSNQ15517 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CDSNQ15517 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CDSNQ15517 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CDSNQ15517 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CDSNQ15517 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CDSNQ15517 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CDSNQ15517 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CDSNQ15517 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
CDSNQ15517 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CDSNQ15517 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CDSNQ15517 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
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