Protein–RNA interactions for Protein: Q15399

TLR1, Toll-like receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 786 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR1Q15399 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TLR1Q15399 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TLR1Q15399 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TLR1Q15399 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TLR1Q15399 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TLR1Q15399 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TLR1Q15399 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TLR1Q15399 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TLR1Q15399 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TLR1Q15399 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TLR1Q15399 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TLR1Q15399 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TLR1Q15399 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TLR1Q15399 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TLR1Q15399 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TLR1Q15399 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TLR1Q15399 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TLR1Q15399 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TLR1Q15399 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TLR1Q15399 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TLR1Q15399 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TLR1Q15399 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TLR1Q15399 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TLR1Q15399 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TLR1Q15399 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TLR1Q15399 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TLR1Q15399 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TLR1Q15399 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TLR1Q15399 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TLR1Q15399 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TLR1Q15399 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TLR1Q15399 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TLR1Q15399 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TLR1Q15399 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TLR1Q15399 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TLR1Q15399 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TLR1Q15399 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TLR1Q15399 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TLR1Q15399 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TLR1Q15399 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TLR1Q15399 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TLR1Q15399 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TLR1Q15399 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TLR1Q15399 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TLR1Q15399 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TLR1Q15399 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TLR1Q15399 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TLR1Q15399 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TLR1Q15399 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TLR1Q15399 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TLR1Q15399 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TLR1Q15399 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TLR1Q15399 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TLR1Q15399 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TLR1Q15399 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TLR1Q15399 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TLR1Q15399 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TLR1Q15399 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TLR1Q15399 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TLR1Q15399 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TLR1Q15399 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TLR1Q15399 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TLR1Q15399 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TLR1Q15399 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TLR1Q15399 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TLR1Q15399 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TLR1Q15399 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TLR1Q15399 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TLR1Q15399 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TLR1Q15399 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TLR1Q15399 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TLR1Q15399 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TLR1Q15399 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TLR1Q15399 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TLR1Q15399 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TLR1Q15399 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TLR1Q15399 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TLR1Q15399 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TLR1Q15399 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TLR1Q15399 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TLR1Q15399 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TLR1Q15399 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TLR1Q15399 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TLR1Q15399 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TLR1Q15399 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TLR1Q15399 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TLR1Q15399 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TLR1Q15399 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TLR1Q15399 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TLR1Q15399 AC120057.1-201ENST00000483947 663 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TLR1Q15399 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TLR1Q15399 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TLR1Q15399 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TLR1Q15399 NIFKP4-201ENST00000567275 1192 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TLR1Q15399 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TLR1Q15399 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TLR1Q15399 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TLR1Q15399 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TLR1Q15399 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TLR1Q15399 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
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