Protein–RNA interactions for Protein: Q15113

PCOLCE, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCEQ15113 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PCOLCEQ15113 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCOLCEQ15113 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCOLCEQ15113 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PCOLCEQ15113 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCOLCEQ15113 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCOLCEQ15113 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PCOLCEQ15113 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCOLCEQ15113 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCOLCEQ15113 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCOLCEQ15113 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCOLCEQ15113 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCOLCEQ15113 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCOLCEQ15113 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PCOLCEQ15113 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PCOLCEQ15113 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCOLCEQ15113 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCOLCEQ15113 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCOLCEQ15113 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCOLCEQ15113 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCOLCEQ15113 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCOLCEQ15113 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCOLCEQ15113 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCOLCEQ15113 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCOLCEQ15113 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCOLCEQ15113 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCOLCEQ15113 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCOLCEQ15113 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PCOLCEQ15113 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PCOLCEQ15113 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PCOLCEQ15113 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PCOLCEQ15113 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PCOLCEQ15113 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PCOLCEQ15113 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PCOLCEQ15113 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PCOLCEQ15113 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PCOLCEQ15113 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PCOLCEQ15113 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PCOLCEQ15113 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PCOLCEQ15113 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PCOLCEQ15113 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PCOLCEQ15113 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PCOLCEQ15113 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PCOLCEQ15113 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PCOLCEQ15113 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PCOLCEQ15113 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PCOLCEQ15113 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PCOLCEQ15113 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PCOLCEQ15113 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PCOLCEQ15113 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PCOLCEQ15113 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PCOLCEQ15113 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PCOLCEQ15113 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PCOLCEQ15113 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PCOLCEQ15113 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PCOLCEQ15113 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PCOLCEQ15113 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PCOLCEQ15113 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PCOLCEQ15113 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PCOLCEQ15113 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PCOLCEQ15113 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PCOLCEQ15113 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PCOLCEQ15113 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PCOLCEQ15113 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PCOLCEQ15113 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PCOLCEQ15113 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PCOLCEQ15113 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PCOLCEQ15113 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PCOLCEQ15113 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PCOLCEQ15113 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PCOLCEQ15113 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PCOLCEQ15113 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PCOLCEQ15113 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PCOLCEQ15113 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PCOLCEQ15113 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PCOLCEQ15113 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PCOLCEQ15113 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PCOLCEQ15113 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PCOLCEQ15113 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PCOLCEQ15113 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PCOLCEQ15113 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PCOLCEQ15113 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PCOLCEQ15113 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PCOLCEQ15113 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PCOLCEQ15113 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PCOLCEQ15113 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PCOLCEQ15113 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PCOLCEQ15113 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PCOLCEQ15113 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PCOLCEQ15113 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PCOLCEQ15113 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PCOLCEQ15113 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PCOLCEQ15113 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PCOLCEQ15113 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PCOLCEQ15113 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PCOLCEQ15113 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PCOLCEQ15113 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PCOLCEQ15113 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PCOLCEQ15113 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PCOLCEQ15113 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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