Protein–RNA interactions for Protein: Q14761

PTPRCAP, Protein tyrosine phosphatase receptor type C-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCAPQ14761 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRCAPQ14761 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRCAPQ14761 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRCAPQ14761 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRCAPQ14761 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRCAPQ14761 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRCAPQ14761 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRCAPQ14761 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRCAPQ14761 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRCAPQ14761 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRCAPQ14761 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRCAPQ14761 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRCAPQ14761 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRCAPQ14761 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRCAPQ14761 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRCAPQ14761 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRCAPQ14761 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRCAPQ14761 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRCAPQ14761 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRCAPQ14761 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRCAPQ14761 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRCAPQ14761 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRCAPQ14761 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRCAPQ14761 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRCAPQ14761 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRCAPQ14761 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRCAPQ14761 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRCAPQ14761 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRCAPQ14761 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRCAPQ14761 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRCAPQ14761 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRCAPQ14761 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRCAPQ14761 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRCAPQ14761 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRCAPQ14761 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRCAPQ14761 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRCAPQ14761 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRCAPQ14761 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRCAPQ14761 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRCAPQ14761 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPRCAPQ14761 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPRCAPQ14761 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPRCAPQ14761 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPRCAPQ14761 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPRCAPQ14761 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPRCAPQ14761 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPRCAPQ14761 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPRCAPQ14761 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPRCAPQ14761 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPRCAPQ14761 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPRCAPQ14761 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPRCAPQ14761 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPRCAPQ14761 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPRCAPQ14761 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPRCAPQ14761 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPRCAPQ14761 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPRCAPQ14761 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPRCAPQ14761 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPRCAPQ14761 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPRCAPQ14761 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPRCAPQ14761 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPRCAPQ14761 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPRCAPQ14761 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPRCAPQ14761 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPRCAPQ14761 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPRCAPQ14761 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPRCAPQ14761 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPRCAPQ14761 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PTPRCAPQ14761 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PTPRCAPQ14761 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PTPRCAPQ14761 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
PTPRCAPQ14761 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PTPRCAPQ14761 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PTPRCAPQ14761 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PTPRCAPQ14761 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PTPRCAPQ14761 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRCAPQ14761 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRCAPQ14761 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRCAPQ14761 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRCAPQ14761 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRCAPQ14761 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRCAPQ14761 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRCAPQ14761 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRCAPQ14761 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRCAPQ14761 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRCAPQ14761 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRCAPQ14761 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRCAPQ14761 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRCAPQ14761 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRCAPQ14761 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRCAPQ14761 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRCAPQ14761 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRCAPQ14761 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRCAPQ14761 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRCAPQ14761 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRCAPQ14761 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRCAPQ14761 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRCAPQ14761 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRCAPQ14761 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRCAPQ14761 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms