Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

Predictions only

Length 830 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SCARF1Q14162 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SCARF1Q14162 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SCARF1Q14162 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SCARF1Q14162 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SCARF1Q14162 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SCARF1Q14162 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SCARF1Q14162 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SCARF1Q14162 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
SCARF1Q14162 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SCARF1Q14162 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SCARF1Q14162 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
SCARF1Q14162 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC20■□□□□ 0.79
SCARF1Q14162 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
SCARF1Q14162 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC20■□□□□ 0.79
SCARF1Q14162 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SCARF1Q14162 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC20■□□□□ 0.79
SCARF1Q14162 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SCARF1Q14162 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC20■□□□□ 0.79
SCARF1Q14162 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SCARF1Q14162 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SCARF1Q14162 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SCARF1Q14162 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SCARF1Q14162 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SCARF1Q14162 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SCARF1Q14162 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SCARF1Q14162 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SCARF1Q14162 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SCARF1Q14162 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SCARF1Q14162 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SCARF1Q14162 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SCARF1Q14162 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SCARF1Q14162 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SCARF1Q14162 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SCARF1Q14162 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SCARF1Q14162 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SCARF1Q14162 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SCARF1Q14162 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SCARF1Q14162 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SCARF1Q14162 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SCARF1Q14162 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SCARF1Q14162 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SCARF1Q14162 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SCARF1Q14162 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SCARF1Q14162 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SCARF1Q14162 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SCARF1Q14162 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SCARF1Q14162 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SCARF1Q14162 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SCARF1Q14162 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SCARF1Q14162 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SCARF1Q14162 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SCARF1Q14162 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SCARF1Q14162 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
SCARF1Q14162 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
SCARF1Q14162 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SCARF1Q14162 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
SCARF1Q14162 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SCARF1Q14162 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SCARF1Q14162 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SCARF1Q14162 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SCARF1Q14162 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SCARF1Q14162 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SCARF1Q14162 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SCARF1Q14162 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SCARF1Q14162 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SCARF1Q14162 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SCARF1Q14162 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
SCARF1Q14162 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SCARF1Q14162 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SCARF1Q14162 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SCARF1Q14162 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SCARF1Q14162 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SCARF1Q14162 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SCARF1Q14162 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SCARF1Q14162 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SCARF1Q14162 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SCARF1Q14162 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SCARF1Q14162 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
SCARF1Q14162 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SCARF1Q14162 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SCARF1Q14162 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SCARF1Q14162 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SCARF1Q14162 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SCARF1Q14162 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SCARF1Q14162 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SCARF1Q14162 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SCARF1Q14162 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SCARF1Q14162 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SCARF1Q14162 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SCARF1Q14162 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SCARF1Q14162 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SCARF1Q14162 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SCARF1Q14162 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SCARF1Q14162 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SCARF1Q14162 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
SCARF1Q14162 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SCARF1Q14162 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SCARF1Q14162 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SCARF1Q14162 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.3 ms