Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

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Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CUL4AQ13619 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CUL4AQ13619 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
CUL4AQ13619 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CUL4AQ13619 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CUL4AQ13619 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
CUL4AQ13619 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
CUL4AQ13619 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
CUL4AQ13619 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CUL4AQ13619 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CUL4AQ13619 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CUL4AQ13619 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
CUL4AQ13619 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CUL4AQ13619 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CUL4AQ13619 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CUL4AQ13619 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CUL4AQ13619 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CUL4AQ13619 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CUL4AQ13619 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CUL4AQ13619 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CUL4AQ13619 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CUL4AQ13619 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CUL4AQ13619 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CUL4AQ13619 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CUL4AQ13619 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CUL4AQ13619 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CUL4AQ13619 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CUL4AQ13619 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
CUL4AQ13619 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CUL4AQ13619 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CUL4AQ13619 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CUL4AQ13619 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CUL4AQ13619 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CUL4AQ13619 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CUL4AQ13619 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CUL4AQ13619 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CUL4AQ13619 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CUL4AQ13619 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CUL4AQ13619 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CUL4AQ13619 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CUL4AQ13619 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CUL4AQ13619 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CUL4AQ13619 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CUL4AQ13619 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CUL4AQ13619 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CUL4AQ13619 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CUL4AQ13619 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
CUL4AQ13619 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CUL4AQ13619 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CUL4AQ13619 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CUL4AQ13619 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CUL4AQ13619 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CUL4AQ13619 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CUL4AQ13619 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CUL4AQ13619 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CUL4AQ13619 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
CUL4AQ13619 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CUL4AQ13619 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CUL4AQ13619 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
CUL4AQ13619 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CUL4AQ13619 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CUL4AQ13619 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CUL4AQ13619 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CUL4AQ13619 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CUL4AQ13619 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CUL4AQ13619 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CUL4AQ13619 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CUL4AQ13619 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CUL4AQ13619 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CUL4AQ13619 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CUL4AQ13619 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CUL4AQ13619 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
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CUL4AQ13619 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CUL4AQ13619 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
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CUL4AQ13619 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CUL4AQ13619 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CUL4AQ13619 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CUL4AQ13619 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CUL4AQ13619 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CUL4AQ13619 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CUL4AQ13619 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CUL4AQ13619 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CUL4AQ13619 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CUL4AQ13619 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CUL4AQ13619 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CUL4AQ13619 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CUL4AQ13619 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CUL4AQ13619 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CUL4AQ13619 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CUL4AQ13619 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CUL4AQ13619 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CUL4AQ13619 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CUL4AQ13619 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CUL4AQ13619 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
CUL4AQ13619 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CUL4AQ13619 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CUL4AQ13619 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CUL4AQ13619 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
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