Protein–RNA interactions for Protein: Q13515

BFSP2, Phakinin, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BFSP2Q13515 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BFSP2Q13515 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BFSP2Q13515 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BFSP2Q13515 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BFSP2Q13515 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BFSP2Q13515 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BFSP2Q13515 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BFSP2Q13515 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BFSP2Q13515 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BFSP2Q13515 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BFSP2Q13515 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BFSP2Q13515 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
BFSP2Q13515 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
BFSP2Q13515 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
BFSP2Q13515 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BFSP2Q13515 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BFSP2Q13515 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BFSP2Q13515 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BFSP2Q13515 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BFSP2Q13515 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BFSP2Q13515 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BFSP2Q13515 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BFSP2Q13515 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BFSP2Q13515 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BFSP2Q13515 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
BFSP2Q13515 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BFSP2Q13515 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BFSP2Q13515 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BFSP2Q13515 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BFSP2Q13515 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BFSP2Q13515 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BFSP2Q13515 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BFSP2Q13515 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BFSP2Q13515 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BFSP2Q13515 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BFSP2Q13515 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BFSP2Q13515 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BFSP2Q13515 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BFSP2Q13515 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BFSP2Q13515 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BFSP2Q13515 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BFSP2Q13515 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BFSP2Q13515 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BFSP2Q13515 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BFSP2Q13515 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
BFSP2Q13515 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BFSP2Q13515 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
BFSP2Q13515 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BFSP2Q13515 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BFSP2Q13515 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
BFSP2Q13515 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BFSP2Q13515 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
BFSP2Q13515 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BFSP2Q13515 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BFSP2Q13515 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BFSP2Q13515 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BFSP2Q13515 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BFSP2Q13515 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BFSP2Q13515 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BFSP2Q13515 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BFSP2Q13515 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
BFSP2Q13515 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BFSP2Q13515 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BFSP2Q13515 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BFSP2Q13515 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BFSP2Q13515 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BFSP2Q13515 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BFSP2Q13515 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BFSP2Q13515 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BFSP2Q13515 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BFSP2Q13515 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BFSP2Q13515 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
BFSP2Q13515 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BFSP2Q13515 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BFSP2Q13515 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
BFSP2Q13515 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BFSP2Q13515 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
BFSP2Q13515 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BFSP2Q13515 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BFSP2Q13515 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BFSP2Q13515 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
BFSP2Q13515 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BFSP2Q13515 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BFSP2Q13515 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BFSP2Q13515 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BFSP2Q13515 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
BFSP2Q13515 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
BFSP2Q13515 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
BFSP2Q13515 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BFSP2Q13515 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
BFSP2Q13515 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BFSP2Q13515 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
BFSP2Q13515 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
BFSP2Q13515 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
BFSP2Q13515 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
BFSP2Q13515 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
BFSP2Q13515 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
BFSP2Q13515 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
BFSP2Q13515 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
BFSP2Q13515 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms