Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TCIRG1Q13488 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TCIRG1Q13488 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TCIRG1Q13488 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TCIRG1Q13488 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TCIRG1Q13488 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TCIRG1Q13488 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TCIRG1Q13488 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TCIRG1Q13488 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TCIRG1Q13488 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TCIRG1Q13488 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TCIRG1Q13488 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TCIRG1Q13488 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TCIRG1Q13488 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TCIRG1Q13488 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TCIRG1Q13488 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TCIRG1Q13488 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TCIRG1Q13488 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TCIRG1Q13488 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TCIRG1Q13488 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TCIRG1Q13488 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TCIRG1Q13488 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TCIRG1Q13488 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TCIRG1Q13488 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
TCIRG1Q13488 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TCIRG1Q13488 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TCIRG1Q13488 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
TCIRG1Q13488 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TCIRG1Q13488 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TCIRG1Q13488 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TCIRG1Q13488 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TCIRG1Q13488 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TCIRG1Q13488 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TCIRG1Q13488 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TCIRG1Q13488 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TCIRG1Q13488 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TCIRG1Q13488 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TCIRG1Q13488 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TCIRG1Q13488 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
TCIRG1Q13488 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
TCIRG1Q13488 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TCIRG1Q13488 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TCIRG1Q13488 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TCIRG1Q13488 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TCIRG1Q13488 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TCIRG1Q13488 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TCIRG1Q13488 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TCIRG1Q13488 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TCIRG1Q13488 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TCIRG1Q13488 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TCIRG1Q13488 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TCIRG1Q13488 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TCIRG1Q13488 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
TCIRG1Q13488 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TCIRG1Q13488 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TCIRG1Q13488 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TCIRG1Q13488 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TCIRG1Q13488 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TCIRG1Q13488 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TCIRG1Q13488 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TCIRG1Q13488 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TCIRG1Q13488 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TCIRG1Q13488 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TCIRG1Q13488 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TCIRG1Q13488 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TCIRG1Q13488 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TCIRG1Q13488 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TCIRG1Q13488 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TCIRG1Q13488 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TCIRG1Q13488 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TCIRG1Q13488 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TCIRG1Q13488 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TCIRG1Q13488 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TCIRG1Q13488 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TCIRG1Q13488 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TCIRG1Q13488 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TCIRG1Q13488 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TCIRG1Q13488 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TCIRG1Q13488 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TCIRG1Q13488 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TCIRG1Q13488 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TCIRG1Q13488 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TCIRG1Q13488 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TCIRG1Q13488 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
TCIRG1Q13488 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TCIRG1Q13488 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TCIRG1Q13488 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TCIRG1Q13488 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TCIRG1Q13488 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TCIRG1Q13488 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TCIRG1Q13488 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TCIRG1Q13488 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TCIRG1Q13488 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TCIRG1Q13488 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TCIRG1Q13488 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TCIRG1Q13488 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TCIRG1Q13488 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TCIRG1Q13488 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TCIRG1Q13488 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
TCIRG1Q13488 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
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