Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
SMAD4Q13485 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
SMAD4Q13485 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
SMAD4Q13485 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SMAD4Q13485 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMAD4Q13485 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMAD4Q13485 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMAD4Q13485 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMAD4Q13485 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMAD4Q13485 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMAD4Q13485 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMAD4Q13485 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMAD4Q13485 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMAD4Q13485 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMAD4Q13485 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMAD4Q13485 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMAD4Q13485 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMAD4Q13485 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMAD4Q13485 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMAD4Q13485 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMAD4Q13485 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMAD4Q13485 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMAD4Q13485 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMAD4Q13485 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMAD4Q13485 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMAD4Q13485 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMAD4Q13485 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMAD4Q13485 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMAD4Q13485 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMAD4Q13485 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMAD4Q13485 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMAD4Q13485 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMAD4Q13485 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMAD4Q13485 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMAD4Q13485 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMAD4Q13485 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMAD4Q13485 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMAD4Q13485 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMAD4Q13485 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMAD4Q13485 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMAD4Q13485 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMAD4Q13485 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMAD4Q13485 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMAD4Q13485 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SMAD4Q13485 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SMAD4Q13485 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMAD4Q13485 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMAD4Q13485 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMAD4Q13485 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMAD4Q13485 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMAD4Q13485 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMAD4Q13485 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMAD4Q13485 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMAD4Q13485 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMAD4Q13485 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMAD4Q13485 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMAD4Q13485 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMAD4Q13485 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMAD4Q13485 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMAD4Q13485 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMAD4Q13485 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMAD4Q13485 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMAD4Q13485 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMAD4Q13485 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMAD4Q13485 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMAD4Q13485 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMAD4Q13485 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMAD4Q13485 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMAD4Q13485 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMAD4Q13485 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMAD4Q13485 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMAD4Q13485 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMAD4Q13485 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMAD4Q13485 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMAD4Q13485 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMAD4Q13485 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SMAD4Q13485 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SMAD4Q13485 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMAD4Q13485 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMAD4Q13485 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMAD4Q13485 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMAD4Q13485 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMAD4Q13485 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMAD4Q13485 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMAD4Q13485 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMAD4Q13485 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMAD4Q13485 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMAD4Q13485 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMAD4Q13485 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMAD4Q13485 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SMAD4Q13485 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMAD4Q13485 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMAD4Q13485 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMAD4Q13485 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMAD4Q13485 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMAD4Q13485 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMAD4Q13485 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMAD4Q13485 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMAD4Q13485 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMAD4Q13485 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
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