Protein–RNA interactions for Protein: Q13425

SNTB2, Beta-2-syntrophin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTB2Q13425 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SNTB2Q13425 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SNTB2Q13425 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SNTB2Q13425 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SNTB2Q13425 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SNTB2Q13425 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
SNTB2Q13425 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SNTB2Q13425 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SNTB2Q13425 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SNTB2Q13425 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SNTB2Q13425 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
SNTB2Q13425 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SNTB2Q13425 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SNTB2Q13425 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SNTB2Q13425 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SNTB2Q13425 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SNTB2Q13425 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SNTB2Q13425 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SNTB2Q13425 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
SNTB2Q13425 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SNTB2Q13425 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SNTB2Q13425 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SNTB2Q13425 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
SNTB2Q13425 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SNTB2Q13425 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SNTB2Q13425 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SNTB2Q13425 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SNTB2Q13425 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
SNTB2Q13425 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SNTB2Q13425 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SNTB2Q13425 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SNTB2Q13425 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SNTB2Q13425 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SNTB2Q13425 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SNTB2Q13425 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SNTB2Q13425 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SNTB2Q13425 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SNTB2Q13425 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SNTB2Q13425 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SNTB2Q13425 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SNTB2Q13425 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SNTB2Q13425 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SNTB2Q13425 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SNTB2Q13425 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SNTB2Q13425 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SNTB2Q13425 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SNTB2Q13425 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SNTB2Q13425 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SNTB2Q13425 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SNTB2Q13425 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SNTB2Q13425 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SNTB2Q13425 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SNTB2Q13425 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SNTB2Q13425 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SNTB2Q13425 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SNTB2Q13425 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SNTB2Q13425 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SNTB2Q13425 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SNTB2Q13425 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SNTB2Q13425 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SNTB2Q13425 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SNTB2Q13425 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SNTB2Q13425 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SNTB2Q13425 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SNTB2Q13425 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SNTB2Q13425 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SNTB2Q13425 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SNTB2Q13425 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SNTB2Q13425 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SNTB2Q13425 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SNTB2Q13425 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SNTB2Q13425 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SNTB2Q13425 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SNTB2Q13425 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SNTB2Q13425 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SNTB2Q13425 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SNTB2Q13425 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SNTB2Q13425 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SNTB2Q13425 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SNTB2Q13425 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SNTB2Q13425 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SNTB2Q13425 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SNTB2Q13425 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SNTB2Q13425 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SNTB2Q13425 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SNTB2Q13425 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SNTB2Q13425 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SNTB2Q13425 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SNTB2Q13425 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SNTB2Q13425 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SNTB2Q13425 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SNTB2Q13425 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SNTB2Q13425 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SNTB2Q13425 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SNTB2Q13425 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SNTB2Q13425 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
SNTB2Q13425 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SNTB2Q13425 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SNTB2Q13425 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SNTB2Q13425 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms