Protein–RNA interactions for Protein: Q13393

PLD1, Phospholipase D1, humanhuman

Predictions only

Length 1,074 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLD1Q13393 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PLD1Q13393 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PLD1Q13393 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PLD1Q13393 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PLD1Q13393 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PLD1Q13393 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PLD1Q13393 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PLD1Q13393 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PLD1Q13393 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PLD1Q13393 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PLD1Q13393 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PLD1Q13393 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PLD1Q13393 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PLD1Q13393 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PLD1Q13393 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PLD1Q13393 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PLD1Q13393 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PLD1Q13393 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PLD1Q13393 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PLD1Q13393 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PLD1Q13393 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PLD1Q13393 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PLD1Q13393 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PLD1Q13393 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PLD1Q13393 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PLD1Q13393 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PLD1Q13393 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PLD1Q13393 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PLD1Q13393 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PLD1Q13393 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PLD1Q13393 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PLD1Q13393 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PLD1Q13393 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PLD1Q13393 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PLD1Q13393 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PLD1Q13393 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PLD1Q13393 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PLD1Q13393 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PLD1Q13393 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PLD1Q13393 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PLD1Q13393 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PLD1Q13393 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PLD1Q13393 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PLD1Q13393 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PLD1Q13393 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PLD1Q13393 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PLD1Q13393 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PLD1Q13393 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PLD1Q13393 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PLD1Q13393 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PLD1Q13393 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PLD1Q13393 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PLD1Q13393 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PLD1Q13393 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PLD1Q13393 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PLD1Q13393 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PLD1Q13393 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PLD1Q13393 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PLD1Q13393 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PLD1Q13393 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PLD1Q13393 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PLD1Q13393 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PLD1Q13393 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PLD1Q13393 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PLD1Q13393 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PLD1Q13393 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PLD1Q13393 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PLD1Q13393 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PLD1Q13393 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
PLD1Q13393 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
PLD1Q13393 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
PLD1Q13393 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PLD1Q13393 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PLD1Q13393 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PLD1Q13393 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PLD1Q13393 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PLD1Q13393 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PLD1Q13393 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PLD1Q13393 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PLD1Q13393 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PLD1Q13393 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PLD1Q13393 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PLD1Q13393 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PLD1Q13393 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PLD1Q13393 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PLD1Q13393 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PLD1Q13393 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PLD1Q13393 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PLD1Q13393 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PLD1Q13393 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PLD1Q13393 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PLD1Q13393 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PLD1Q13393 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PLD1Q13393 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PLD1Q13393 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PLD1Q13393 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PLD1Q13393 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PLD1Q13393 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PLD1Q13393 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PLD1Q13393 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms