Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
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ITGB3BPQ13352 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ITGB3BPQ13352 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITGB3BPQ13352 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITGB3BPQ13352 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITGB3BPQ13352 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITGB3BPQ13352 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITGB3BPQ13352 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITGB3BPQ13352 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITGB3BPQ13352 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITGB3BPQ13352 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITGB3BPQ13352 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITGB3BPQ13352 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITGB3BPQ13352 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITGB3BPQ13352 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITGB3BPQ13352 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITGB3BPQ13352 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITGB3BPQ13352 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITGB3BPQ13352 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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ITGB3BPQ13352 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITGB3BPQ13352 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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ITGB3BPQ13352 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
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ITGB3BPQ13352 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITGB3BPQ13352 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITGB3BPQ13352 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITGB3BPQ13352 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITGB3BPQ13352 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITGB3BPQ13352 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITGB3BPQ13352 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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ITGB3BPQ13352 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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ITGB3BPQ13352 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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ITGB3BPQ13352 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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ITGB3BPQ13352 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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ITGB3BPQ13352 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGB3BPQ13352 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGB3BPQ13352 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGB3BPQ13352 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGB3BPQ13352 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGB3BPQ13352 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGB3BPQ13352 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGB3BPQ13352 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGB3BPQ13352 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGB3BPQ13352 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGB3BPQ13352 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGB3BPQ13352 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGB3BPQ13352 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGB3BPQ13352 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGB3BPQ13352 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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