Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 FHDC1-202ENST00000511601 6583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 TAB2-208ENST00000636456 3092 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 DNAJC3-AS1-201ENST00000499499 2908 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 GALC-206ENST00000544807 2528 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 ACTR10-201ENST00000254286 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 AC093668.2-201ENST00000481893 3569 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 AC105052.1-201ENST00000519541 3569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 DLX3-201ENST00000434704 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 SYCP2L-201ENST00000283141 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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