Protein–RNA interactions for Protein: Q13133

NR1H3, Oxysterols receptor LXR-alpha, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H3Q13133 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NR1H3Q13133 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
NR1H3Q13133 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
NR1H3Q13133 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NR1H3Q13133 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
NR1H3Q13133 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
NR1H3Q13133 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NR1H3Q13133 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NR1H3Q13133 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NR1H3Q13133 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NR1H3Q13133 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NR1H3Q13133 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NR1H3Q13133 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
NR1H3Q13133 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NR1H3Q13133 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NR1H3Q13133 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NR1H3Q13133 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NR1H3Q13133 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
NR1H3Q13133 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
NR1H3Q13133 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NR1H3Q13133 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NR1H3Q13133 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NR1H3Q13133 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NR1H3Q13133 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NR1H3Q13133 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NR1H3Q13133 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NR1H3Q13133 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NR1H3Q13133 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NR1H3Q13133 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NR1H3Q13133 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NR1H3Q13133 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NR1H3Q13133 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NR1H3Q13133 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NR1H3Q13133 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NR1H3Q13133 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NR1H3Q13133 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NR1H3Q13133 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NR1H3Q13133 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NR1H3Q13133 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NR1H3Q13133 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NR1H3Q13133 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NR1H3Q13133 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NR1H3Q13133 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NR1H3Q13133 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NR1H3Q13133 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NR1H3Q13133 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NR1H3Q13133 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NR1H3Q13133 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NR1H3Q13133 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NR1H3Q13133 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NR1H3Q13133 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NR1H3Q13133 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NR1H3Q13133 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NR1H3Q13133 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NR1H3Q13133 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
NR1H3Q13133 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NR1H3Q13133 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
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NR1H3Q13133 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NR1H3Q13133 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NR1H3Q13133 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
NR1H3Q13133 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NR1H3Q13133 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NR1H3Q13133 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NR1H3Q13133 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
NR1H3Q13133 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NR1H3Q13133 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NR1H3Q13133 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NR1H3Q13133 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NR1H3Q13133 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NR1H3Q13133 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NR1H3Q13133 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NR1H3Q13133 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NR1H3Q13133 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NR1H3Q13133 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NR1H3Q13133 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NR1H3Q13133 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NR1H3Q13133 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NR1H3Q13133 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NR1H3Q13133 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NR1H3Q13133 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NR1H3Q13133 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NR1H3Q13133 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NR1H3Q13133 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NR1H3Q13133 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NR1H3Q13133 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NR1H3Q13133 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NR1H3Q13133 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NR1H3Q13133 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NR1H3Q13133 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NR1H3Q13133 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NR1H3Q13133 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
NR1H3Q13133 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NR1H3Q13133 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NR1H3Q13133 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NR1H3Q13133 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NR1H3Q13133 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NR1H3Q13133 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
NR1H3Q13133 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NR1H3Q13133 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
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