Protein–RNA interactions for Protein: Q13084

MRPL28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL28Q13084 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
MRPL28Q13084 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
MRPL28Q13084 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
MRPL28Q13084 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
MRPL28Q13084 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
MRPL28Q13084 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
MRPL28Q13084 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
MRPL28Q13084 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC14.97□□□□□ -0.01
MRPL28Q13084 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
MRPL28Q13084 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
MRPL28Q13084 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
MRPL28Q13084 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
MRPL28Q13084 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
MRPL28Q13084 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
MRPL28Q13084 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
MRPL28Q13084 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
MRPL28Q13084 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
MRPL28Q13084 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
MRPL28Q13084 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
MRPL28Q13084 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
MRPL28Q13084 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
MRPL28Q13084 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
MRPL28Q13084 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
MRPL28Q13084 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
MRPL28Q13084 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
MRPL28Q13084 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
MRPL28Q13084 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
MRPL28Q13084 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
MRPL28Q13084 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
MRPL28Q13084 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
MRPL28Q13084 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
MRPL28Q13084 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
MRPL28Q13084 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
MRPL28Q13084 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
MRPL28Q13084 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
MRPL28Q13084 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
MRPL28Q13084 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
MRPL28Q13084 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
MRPL28Q13084 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
MRPL28Q13084 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
MRPL28Q13084 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
MRPL28Q13084 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC14.96□□□□□ -0.01
MRPL28Q13084 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
MRPL28Q13084 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
MRPL28Q13084 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
MRPL28Q13084 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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MRPL28Q13084 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
MRPL28Q13084 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
MRPL28Q13084 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
MRPL28Q13084 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
MRPL28Q13084 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
MRPL28Q13084 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
MRPL28Q13084 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
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MRPL28Q13084 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
MRPL28Q13084 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
MRPL28Q13084 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
MRPL28Q13084 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
MRPL28Q13084 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
MRPL28Q13084 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
MRPL28Q13084 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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MRPL28Q13084 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
MRPL28Q13084 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
MRPL28Q13084 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
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MRPL28Q13084 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MRPL28Q13084 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
MRPL28Q13084 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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MRPL28Q13084 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MRPL28Q13084 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
MRPL28Q13084 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MRPL28Q13084 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MRPL28Q13084 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
MRPL28Q13084 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
MRPL28Q13084 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MRPL28Q13084 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MRPL28Q13084 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MRPL28Q13084 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MRPL28Q13084 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MRPL28Q13084 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
MRPL28Q13084 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
MRPL28Q13084 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
MRPL28Q13084 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MRPL28Q13084 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
MRPL28Q13084 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
MRPL28Q13084 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MRPL28Q13084 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
MRPL28Q13084 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
MRPL28Q13084 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
MRPL28Q13084 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
MRPL28Q13084 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
MRPL28Q13084 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
MRPL28Q13084 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MRPL28Q13084 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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