Protein–RNA interactions for Protein: Q12952

FOXL1, Forkhead box protein L1, humanhuman

Predictions only

Length 345 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXL1Q12952 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXL1Q12952 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXL1Q12952 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXL1Q12952 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXL1Q12952 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXL1Q12952 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXL1Q12952 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXL1Q12952 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXL1Q12952 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXL1Q12952 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXL1Q12952 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXL1Q12952 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXL1Q12952 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXL1Q12952 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXL1Q12952 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXL1Q12952 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXL1Q12952 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXL1Q12952 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXL1Q12952 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXL1Q12952 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXL1Q12952 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXL1Q12952 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXL1Q12952 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXL1Q12952 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXL1Q12952 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXL1Q12952 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXL1Q12952 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXL1Q12952 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXL1Q12952 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXL1Q12952 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXL1Q12952 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXL1Q12952 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXL1Q12952 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXL1Q12952 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXL1Q12952 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXL1Q12952 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXL1Q12952 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXL1Q12952 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXL1Q12952 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXL1Q12952 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXL1Q12952 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXL1Q12952 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXL1Q12952 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FOXL1Q12952 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FOXL1Q12952 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FOXL1Q12952 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FOXL1Q12952 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FOXL1Q12952 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FOXL1Q12952 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FOXL1Q12952 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FOXL1Q12952 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FOXL1Q12952 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FOXL1Q12952 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FOXL1Q12952 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FOXL1Q12952 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FOXL1Q12952 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FOXL1Q12952 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FOXL1Q12952 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FOXL1Q12952 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FOXL1Q12952 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FOXL1Q12952 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FOXL1Q12952 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FOXL1Q12952 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FOXL1Q12952 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FOXL1Q12952 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FOXL1Q12952 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FOXL1Q12952 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FOXL1Q12952 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FOXL1Q12952 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FOXL1Q12952 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
FOXL1Q12952 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FOXL1Q12952 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FOXL1Q12952 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FOXL1Q12952 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FOXL1Q12952 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FOXL1Q12952 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FOXL1Q12952 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FOXL1Q12952 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FOXL1Q12952 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FOXL1Q12952 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FOXL1Q12952 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FOXL1Q12952 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FOXL1Q12952 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
FOXL1Q12952 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
FOXL1Q12952 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FOXL1Q12952 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FOXL1Q12952 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FOXL1Q12952 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FOXL1Q12952 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FOXL1Q12952 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FOXL1Q12952 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FOXL1Q12952 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FOXL1Q12952 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FOXL1Q12952 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
FOXL1Q12952 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FOXL1Q12952 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FOXL1Q12952 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FOXL1Q12952 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FOXL1Q12952 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
FOXL1Q12952 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms