Protein–RNA interactions for Protein: Q12840

KIF5A, Kinesin heavy chain isoform 5A, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF5AQ12840 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KIF5AQ12840 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KIF5AQ12840 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KIF5AQ12840 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KIF5AQ12840 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KIF5AQ12840 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KIF5AQ12840 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KIF5AQ12840 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KIF5AQ12840 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KIF5AQ12840 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KIF5AQ12840 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
KIF5AQ12840 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
KIF5AQ12840 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KIF5AQ12840 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KIF5AQ12840 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KIF5AQ12840 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KIF5AQ12840 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KIF5AQ12840 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KIF5AQ12840 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KIF5AQ12840 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
KIF5AQ12840 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KIF5AQ12840 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KIF5AQ12840 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KIF5AQ12840 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KIF5AQ12840 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KIF5AQ12840 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KIF5AQ12840 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KIF5AQ12840 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KIF5AQ12840 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KIF5AQ12840 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KIF5AQ12840 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KIF5AQ12840 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KIF5AQ12840 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KIF5AQ12840 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
KIF5AQ12840 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KIF5AQ12840 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
KIF5AQ12840 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KIF5AQ12840 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KIF5AQ12840 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KIF5AQ12840 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KIF5AQ12840 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KIF5AQ12840 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KIF5AQ12840 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KIF5AQ12840 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KIF5AQ12840 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KIF5AQ12840 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KIF5AQ12840 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KIF5AQ12840 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KIF5AQ12840 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KIF5AQ12840 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KIF5AQ12840 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KIF5AQ12840 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KIF5AQ12840 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KIF5AQ12840 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KIF5AQ12840 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KIF5AQ12840 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KIF5AQ12840 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KIF5AQ12840 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KIF5AQ12840 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KIF5AQ12840 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KIF5AQ12840 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KIF5AQ12840 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KIF5AQ12840 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KIF5AQ12840 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KIF5AQ12840 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KIF5AQ12840 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KIF5AQ12840 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KIF5AQ12840 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KIF5AQ12840 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KIF5AQ12840 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KIF5AQ12840 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KIF5AQ12840 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KIF5AQ12840 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KIF5AQ12840 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KIF5AQ12840 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
KIF5AQ12840 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KIF5AQ12840 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KIF5AQ12840 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
KIF5AQ12840 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
KIF5AQ12840 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KIF5AQ12840 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KIF5AQ12840 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KIF5AQ12840 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KIF5AQ12840 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KIF5AQ12840 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
KIF5AQ12840 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
KIF5AQ12840 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KIF5AQ12840 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KIF5AQ12840 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KIF5AQ12840 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KIF5AQ12840 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KIF5AQ12840 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KIF5AQ12840 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KIF5AQ12840 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
KIF5AQ12840 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KIF5AQ12840 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KIF5AQ12840 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KIF5AQ12840 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KIF5AQ12840 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KIF5AQ12840 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms