Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BPTFQ12830 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BPTFQ12830 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BPTFQ12830 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BPTFQ12830 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BPTFQ12830 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BPTFQ12830 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BPTFQ12830 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BPTFQ12830 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
BPTFQ12830 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BPTFQ12830 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BPTFQ12830 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BPTFQ12830 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
BPTFQ12830 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BPTFQ12830 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BPTFQ12830 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BPTFQ12830 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BPTFQ12830 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BPTFQ12830 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BPTFQ12830 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BPTFQ12830 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BPTFQ12830 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
BPTFQ12830 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BPTFQ12830 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BPTFQ12830 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
BPTFQ12830 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BPTFQ12830 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BPTFQ12830 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BPTFQ12830 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
BPTFQ12830 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BPTFQ12830 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BPTFQ12830 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BPTFQ12830 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BPTFQ12830 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BPTFQ12830 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BPTFQ12830 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BPTFQ12830 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BPTFQ12830 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BPTFQ12830 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
BPTFQ12830 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BPTFQ12830 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BPTFQ12830 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BPTFQ12830 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BPTFQ12830 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BPTFQ12830 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BPTFQ12830 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BPTFQ12830 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BPTFQ12830 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BPTFQ12830 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
BPTFQ12830 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BPTFQ12830 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BPTFQ12830 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
BPTFQ12830 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
BPTFQ12830 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
BPTFQ12830 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BPTFQ12830 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
BPTFQ12830 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
BPTFQ12830 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BPTFQ12830 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BPTFQ12830 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BPTFQ12830 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BPTFQ12830 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BPTFQ12830 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BPTFQ12830 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BPTFQ12830 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BPTFQ12830 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BPTFQ12830 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BPTFQ12830 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BPTFQ12830 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BPTFQ12830 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BPTFQ12830 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BPTFQ12830 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
BPTFQ12830 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BPTFQ12830 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BPTFQ12830 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BPTFQ12830 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BPTFQ12830 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BPTFQ12830 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BPTFQ12830 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BPTFQ12830 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BPTFQ12830 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BPTFQ12830 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BPTFQ12830 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BPTFQ12830 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BPTFQ12830 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BPTFQ12830 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BPTFQ12830 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BPTFQ12830 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BPTFQ12830 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BPTFQ12830 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BPTFQ12830 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BPTFQ12830 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BPTFQ12830 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BPTFQ12830 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BPTFQ12830 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BPTFQ12830 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BPTFQ12830 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BPTFQ12830 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BPTFQ12830 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BPTFQ12830 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
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