Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAF6

SYCN, Syncollin, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCNQ0VAF6 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC10.96□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
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