Protein–RNA interactions for Protein: Q09428

ABCC8, ATP-binding cassette sub-family C member 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC8Q09428 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ABCC8Q09428 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ABCC8Q09428 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ABCC8Q09428 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ABCC8Q09428 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ABCC8Q09428 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ABCC8Q09428 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ABCC8Q09428 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
ABCC8Q09428 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ABCC8Q09428 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ABCC8Q09428 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ABCC8Q09428 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ABCC8Q09428 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ABCC8Q09428 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ABCC8Q09428 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ABCC8Q09428 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ABCC8Q09428 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ABCC8Q09428 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ABCC8Q09428 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ABCC8Q09428 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ABCC8Q09428 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ABCC8Q09428 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ABCC8Q09428 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ABCC8Q09428 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ABCC8Q09428 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ABCC8Q09428 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ABCC8Q09428 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ABCC8Q09428 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
ABCC8Q09428 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ABCC8Q09428 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ABCC8Q09428 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ABCC8Q09428 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ABCC8Q09428 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ABCC8Q09428 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
ABCC8Q09428 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ABCC8Q09428 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ABCC8Q09428 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
ABCC8Q09428 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ABCC8Q09428 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ABCC8Q09428 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ABCC8Q09428 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ABCC8Q09428 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
ABCC8Q09428 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ABCC8Q09428 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ABCC8Q09428 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ABCC8Q09428 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ABCC8Q09428 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
ABCC8Q09428 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
ABCC8Q09428 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ABCC8Q09428 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ABCC8Q09428 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ABCC8Q09428 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ABCC8Q09428 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ABCC8Q09428 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ABCC8Q09428 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ABCC8Q09428 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ABCC8Q09428 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ABCC8Q09428 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ABCC8Q09428 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ABCC8Q09428 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ABCC8Q09428 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ABCC8Q09428 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ABCC8Q09428 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ABCC8Q09428 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ABCC8Q09428 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ABCC8Q09428 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ABCC8Q09428 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ABCC8Q09428 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ABCC8Q09428 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ABCC8Q09428 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ABCC8Q09428 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ABCC8Q09428 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ABCC8Q09428 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ABCC8Q09428 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ABCC8Q09428 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
ABCC8Q09428 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ABCC8Q09428 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
ABCC8Q09428 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
ABCC8Q09428 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ABCC8Q09428 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ABCC8Q09428 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ABCC8Q09428 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ABCC8Q09428 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
ABCC8Q09428 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ABCC8Q09428 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ABCC8Q09428 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ABCC8Q09428 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ABCC8Q09428 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ABCC8Q09428 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ABCC8Q09428 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ABCC8Q09428 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ABCC8Q09428 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ABCC8Q09428 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
ABCC8Q09428 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ABCC8Q09428 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
ABCC8Q09428 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ABCC8Q09428 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ABCC8Q09428 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ABCC8Q09428 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ABCC8Q09428 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms