Protein–RNA interactions for Protein: Q08623

PUDP, Pseudouridine-5'-phosphatase, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUDPQ08623 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PUDPQ08623 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PUDPQ08623 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PUDPQ08623 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PUDPQ08623 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PUDPQ08623 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PUDPQ08623 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PUDPQ08623 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PUDPQ08623 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PUDPQ08623 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PUDPQ08623 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PUDPQ08623 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PUDPQ08623 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PUDPQ08623 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PUDPQ08623 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PUDPQ08623 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PUDPQ08623 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PUDPQ08623 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PUDPQ08623 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PUDPQ08623 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PUDPQ08623 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PUDPQ08623 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PUDPQ08623 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PUDPQ08623 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PUDPQ08623 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PUDPQ08623 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PUDPQ08623 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PUDPQ08623 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PUDPQ08623 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PUDPQ08623 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PUDPQ08623 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PUDPQ08623 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PUDPQ08623 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PUDPQ08623 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PUDPQ08623 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PUDPQ08623 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PUDPQ08623 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PUDPQ08623 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PUDPQ08623 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PUDPQ08623 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PUDPQ08623 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PUDPQ08623 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PUDPQ08623 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PUDPQ08623 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PUDPQ08623 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PUDPQ08623 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PUDPQ08623 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PUDPQ08623 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PUDPQ08623 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PUDPQ08623 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PUDPQ08623 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PUDPQ08623 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PUDPQ08623 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PUDPQ08623 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PUDPQ08623 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PUDPQ08623 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PUDPQ08623 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PUDPQ08623 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PUDPQ08623 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PUDPQ08623 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PUDPQ08623 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PUDPQ08623 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PUDPQ08623 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PUDPQ08623 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PUDPQ08623 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PUDPQ08623 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PUDPQ08623 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PUDPQ08623 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PUDPQ08623 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PUDPQ08623 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PUDPQ08623 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PUDPQ08623 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PUDPQ08623 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PUDPQ08623 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PUDPQ08623 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PUDPQ08623 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PUDPQ08623 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PUDPQ08623 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PUDPQ08623 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PUDPQ08623 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PUDPQ08623 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PUDPQ08623 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PUDPQ08623 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PUDPQ08623 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PUDPQ08623 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PUDPQ08623 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PUDPQ08623 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PUDPQ08623 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PUDPQ08623 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PUDPQ08623 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PUDPQ08623 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PUDPQ08623 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PUDPQ08623 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PUDPQ08623 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PUDPQ08623 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PUDPQ08623 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PUDPQ08623 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PUDPQ08623 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PUDPQ08623 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PUDPQ08623 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.3 ms