Protein–RNA interactions for Protein: Q08289

CACNB2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB2Q08289 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CACNB2Q08289 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CACNB2Q08289 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CACNB2Q08289 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CACNB2Q08289 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CACNB2Q08289 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CACNB2Q08289 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CACNB2Q08289 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CACNB2Q08289 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CACNB2Q08289 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CACNB2Q08289 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CACNB2Q08289 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CACNB2Q08289 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CACNB2Q08289 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CACNB2Q08289 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CACNB2Q08289 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CACNB2Q08289 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CACNB2Q08289 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CACNB2Q08289 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CACNB2Q08289 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CACNB2Q08289 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CACNB2Q08289 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CACNB2Q08289 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CACNB2Q08289 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CACNB2Q08289 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CACNB2Q08289 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CACNB2Q08289 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CACNB2Q08289 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CACNB2Q08289 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CACNB2Q08289 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CACNB2Q08289 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CACNB2Q08289 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CACNB2Q08289 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CACNB2Q08289 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CACNB2Q08289 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CACNB2Q08289 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CACNB2Q08289 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CACNB2Q08289 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CACNB2Q08289 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CACNB2Q08289 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CACNB2Q08289 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CACNB2Q08289 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CACNB2Q08289 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CACNB2Q08289 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CACNB2Q08289 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CACNB2Q08289 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CACNB2Q08289 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CACNB2Q08289 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CACNB2Q08289 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CACNB2Q08289 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CACNB2Q08289 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CACNB2Q08289 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CACNB2Q08289 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CACNB2Q08289 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CACNB2Q08289 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CACNB2Q08289 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CACNB2Q08289 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CACNB2Q08289 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CACNB2Q08289 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CACNB2Q08289 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CACNB2Q08289 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CACNB2Q08289 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CACNB2Q08289 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CACNB2Q08289 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CACNB2Q08289 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CACNB2Q08289 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CACNB2Q08289 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CACNB2Q08289 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CACNB2Q08289 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CACNB2Q08289 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CACNB2Q08289 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CACNB2Q08289 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CACNB2Q08289 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CACNB2Q08289 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CACNB2Q08289 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CACNB2Q08289 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CACNB2Q08289 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CACNB2Q08289 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CACNB2Q08289 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CACNB2Q08289 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CACNB2Q08289 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CACNB2Q08289 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CACNB2Q08289 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CACNB2Q08289 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CACNB2Q08289 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CACNB2Q08289 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CACNB2Q08289 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CACNB2Q08289 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CACNB2Q08289 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CACNB2Q08289 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CACNB2Q08289 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CACNB2Q08289 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CACNB2Q08289 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CACNB2Q08289 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CACNB2Q08289 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CACNB2Q08289 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CACNB2Q08289 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CACNB2Q08289 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CACNB2Q08289 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CACNB2Q08289 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms