Protein–RNA interactions for Protein: Q07001

CHRND, Acetylcholine receptor subunit delta, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNDQ07001 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CHRNDQ07001 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CHRNDQ07001 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CHRNDQ07001 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CHRNDQ07001 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CHRNDQ07001 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CHRNDQ07001 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CHRNDQ07001 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CHRNDQ07001 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CHRNDQ07001 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CHRNDQ07001 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CHRNDQ07001 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CHRNDQ07001 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CHRNDQ07001 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CHRNDQ07001 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CHRNDQ07001 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CHRNDQ07001 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHRNDQ07001 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHRNDQ07001 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHRNDQ07001 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHRNDQ07001 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHRNDQ07001 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHRNDQ07001 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHRNDQ07001 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHRNDQ07001 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHRNDQ07001 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHRNDQ07001 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHRNDQ07001 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHRNDQ07001 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHRNDQ07001 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CHRNDQ07001 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHRNDQ07001 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHRNDQ07001 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CHRNDQ07001 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHRNDQ07001 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHRNDQ07001 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CHRNDQ07001 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHRNDQ07001 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHRNDQ07001 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHRNDQ07001 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHRNDQ07001 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHRNDQ07001 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHRNDQ07001 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHRNDQ07001 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHRNDQ07001 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHRNDQ07001 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHRNDQ07001 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHRNDQ07001 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHRNDQ07001 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHRNDQ07001 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CHRNDQ07001 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CHRNDQ07001 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHRNDQ07001 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHRNDQ07001 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHRNDQ07001 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHRNDQ07001 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHRNDQ07001 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHRNDQ07001 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHRNDQ07001 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHRNDQ07001 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHRNDQ07001 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHRNDQ07001 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHRNDQ07001 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHRNDQ07001 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CHRNDQ07001 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHRNDQ07001 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHRNDQ07001 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHRNDQ07001 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CHRNDQ07001 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHRNDQ07001 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHRNDQ07001 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHRNDQ07001 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHRNDQ07001 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHRNDQ07001 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHRNDQ07001 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHRNDQ07001 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHRNDQ07001 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHRNDQ07001 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHRNDQ07001 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHRNDQ07001 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHRNDQ07001 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHRNDQ07001 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHRNDQ07001 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHRNDQ07001 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHRNDQ07001 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHRNDQ07001 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHRNDQ07001 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHRNDQ07001 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHRNDQ07001 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHRNDQ07001 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHRNDQ07001 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHRNDQ07001 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHRNDQ07001 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHRNDQ07001 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CHRNDQ07001 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHRNDQ07001 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHRNDQ07001 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHRNDQ07001 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHRNDQ07001 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHRNDQ07001 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.5 ms