Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CALD1Q05682 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CALD1Q05682 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CALD1Q05682 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CALD1Q05682 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CALD1Q05682 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CALD1Q05682 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CALD1Q05682 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CALD1Q05682 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CALD1Q05682 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CALD1Q05682 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CALD1Q05682 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CALD1Q05682 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CALD1Q05682 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CALD1Q05682 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CALD1Q05682 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CALD1Q05682 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CALD1Q05682 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CALD1Q05682 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CALD1Q05682 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CALD1Q05682 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CALD1Q05682 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CALD1Q05682 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CALD1Q05682 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CALD1Q05682 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CALD1Q05682 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CALD1Q05682 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CALD1Q05682 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CALD1Q05682 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CALD1Q05682 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CALD1Q05682 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CALD1Q05682 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CALD1Q05682 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CALD1Q05682 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CALD1Q05682 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CALD1Q05682 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CALD1Q05682 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CALD1Q05682 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CALD1Q05682 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CALD1Q05682 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CALD1Q05682 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CALD1Q05682 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CALD1Q05682 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CALD1Q05682 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CALD1Q05682 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CALD1Q05682 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CALD1Q05682 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CALD1Q05682 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CALD1Q05682 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CALD1Q05682 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CALD1Q05682 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CALD1Q05682 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CALD1Q05682 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CALD1Q05682 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CALD1Q05682 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CALD1Q05682 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CALD1Q05682 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CALD1Q05682 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CALD1Q05682 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CALD1Q05682 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CALD1Q05682 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CALD1Q05682 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CALD1Q05682 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CALD1Q05682 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CALD1Q05682 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CALD1Q05682 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CALD1Q05682 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CALD1Q05682 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CALD1Q05682 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CALD1Q05682 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CALD1Q05682 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CALD1Q05682 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CALD1Q05682 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CALD1Q05682 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CALD1Q05682 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CALD1Q05682 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CALD1Q05682 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CALD1Q05682 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CALD1Q05682 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CALD1Q05682 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CALD1Q05682 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CALD1Q05682 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CALD1Q05682 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CALD1Q05682 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CALD1Q05682 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CALD1Q05682 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CALD1Q05682 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CALD1Q05682 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CALD1Q05682 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CALD1Q05682 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CALD1Q05682 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CALD1Q05682 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CALD1Q05682 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CALD1Q05682 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CALD1Q05682 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CALD1Q05682 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CALD1Q05682 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CALD1Q05682 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CALD1Q05682 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CALD1Q05682 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms