Protein–RNA interactions for Protein: Q03989

ARID5A, AT-rich interactive domain-containing protein 5A, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID5AQ03989 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ARID5AQ03989 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ARID5AQ03989 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ARID5AQ03989 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ARID5AQ03989 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ARID5AQ03989 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ARID5AQ03989 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ARID5AQ03989 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ARID5AQ03989 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ARID5AQ03989 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ARID5AQ03989 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ARID5AQ03989 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ARID5AQ03989 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ARID5AQ03989 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ARID5AQ03989 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ARID5AQ03989 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ARID5AQ03989 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ARID5AQ03989 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ARID5AQ03989 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ARID5AQ03989 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ARID5AQ03989 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ARID5AQ03989 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ARID5AQ03989 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ARID5AQ03989 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ARID5AQ03989 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ARID5AQ03989 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ARID5AQ03989 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ARID5AQ03989 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ARID5AQ03989 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ARID5AQ03989 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ARID5AQ03989 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ARID5AQ03989 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ARID5AQ03989 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ARID5AQ03989 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ARID5AQ03989 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ARID5AQ03989 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ARID5AQ03989 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ARID5AQ03989 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ARID5AQ03989 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ARID5AQ03989 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ARID5AQ03989 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ARID5AQ03989 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ARID5AQ03989 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ARID5AQ03989 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ARID5AQ03989 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ARID5AQ03989 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
ARID5AQ03989 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ARID5AQ03989 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ARID5AQ03989 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ARID5AQ03989 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ARID5AQ03989 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ARID5AQ03989 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ARID5AQ03989 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
ARID5AQ03989 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ARID5AQ03989 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ARID5AQ03989 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARID5AQ03989 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARID5AQ03989 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARID5AQ03989 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARID5AQ03989 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARID5AQ03989 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARID5AQ03989 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARID5AQ03989 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARID5AQ03989 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARID5AQ03989 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARID5AQ03989 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARID5AQ03989 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARID5AQ03989 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARID5AQ03989 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARID5AQ03989 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARID5AQ03989 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ARID5AQ03989 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARID5AQ03989 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARID5AQ03989 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ARID5AQ03989 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ARID5AQ03989 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ARID5AQ03989 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARID5AQ03989 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARID5AQ03989 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARID5AQ03989 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ARID5AQ03989 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARID5AQ03989 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARID5AQ03989 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARID5AQ03989 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARID5AQ03989 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARID5AQ03989 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARID5AQ03989 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARID5AQ03989 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARID5AQ03989 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ARID5AQ03989 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARID5AQ03989 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARID5AQ03989 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARID5AQ03989 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARID5AQ03989 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARID5AQ03989 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARID5AQ03989 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARID5AQ03989 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ARID5AQ03989 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ARID5AQ03989 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ARID5AQ03989 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms