Protein–RNA interactions for Protein: Q03060

CREM, cAMP-responsive element modulator, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREMQ03060 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CREMQ03060 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CREMQ03060 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CREMQ03060 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CREMQ03060 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CREMQ03060 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CREMQ03060 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CREMQ03060 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CREMQ03060 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CREMQ03060 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CREMQ03060 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CREMQ03060 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CREMQ03060 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CREMQ03060 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CREMQ03060 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CREMQ03060 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CREMQ03060 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CREMQ03060 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CREMQ03060 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CREMQ03060 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CREMQ03060 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CREMQ03060 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CREMQ03060 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CREMQ03060 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CREMQ03060 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CREMQ03060 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CREMQ03060 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CREMQ03060 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CREMQ03060 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CREMQ03060 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CREMQ03060 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CREMQ03060 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CREMQ03060 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CREMQ03060 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CREMQ03060 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CREMQ03060 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CREMQ03060 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CREMQ03060 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CREMQ03060 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CREMQ03060 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CREMQ03060 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CREMQ03060 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CREMQ03060 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CREMQ03060 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CREMQ03060 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CREMQ03060 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CREMQ03060 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CREMQ03060 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CREMQ03060 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CREMQ03060 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CREMQ03060 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CREMQ03060 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CREMQ03060 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CREMQ03060 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CREMQ03060 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CREMQ03060 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CREMQ03060 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CREMQ03060 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CREMQ03060 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CREMQ03060 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CREMQ03060 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CREMQ03060 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CREMQ03060 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CREMQ03060 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CREMQ03060 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CREMQ03060 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CREMQ03060 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CREMQ03060 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CREMQ03060 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CREMQ03060 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CREMQ03060 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CREMQ03060 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CREMQ03060 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CREMQ03060 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CREMQ03060 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CREMQ03060 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CREMQ03060 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CREMQ03060 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CREMQ03060 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CREMQ03060 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CREMQ03060 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CREMQ03060 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CREMQ03060 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CREMQ03060 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CREMQ03060 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CREMQ03060 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CREMQ03060 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
CREMQ03060 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CREMQ03060 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CREMQ03060 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CREMQ03060 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CREMQ03060 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CREMQ03060 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CREMQ03060 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CREMQ03060 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CREMQ03060 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CREMQ03060 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CREMQ03060 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CREMQ03060 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CREMQ03060 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms