Protein–RNA interactions for Protein: Q02818

NUCB1, Nucleobindin-1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB1Q02818 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NUCB1Q02818 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
NUCB1Q02818 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
NUCB1Q02818 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
NUCB1Q02818 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NUCB1Q02818 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NUCB1Q02818 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
NUCB1Q02818 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NUCB1Q02818 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
NUCB1Q02818 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
NUCB1Q02818 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NUCB1Q02818 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
NUCB1Q02818 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NUCB1Q02818 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
NUCB1Q02818 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NUCB1Q02818 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
NUCB1Q02818 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NUCB1Q02818 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NUCB1Q02818 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NUCB1Q02818 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NUCB1Q02818 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NUCB1Q02818 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NUCB1Q02818 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NUCB1Q02818 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NUCB1Q02818 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NUCB1Q02818 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NUCB1Q02818 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NUCB1Q02818 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NUCB1Q02818 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NUCB1Q02818 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NUCB1Q02818 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NUCB1Q02818 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NUCB1Q02818 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NUCB1Q02818 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NUCB1Q02818 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NUCB1Q02818 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NUCB1Q02818 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NUCB1Q02818 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NUCB1Q02818 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NUCB1Q02818 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
NUCB1Q02818 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NUCB1Q02818 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NUCB1Q02818 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NUCB1Q02818 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NUCB1Q02818 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NUCB1Q02818 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NUCB1Q02818 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NUCB1Q02818 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NUCB1Q02818 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NUCB1Q02818 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NUCB1Q02818 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NUCB1Q02818 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NUCB1Q02818 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NUCB1Q02818 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NUCB1Q02818 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NUCB1Q02818 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
NUCB1Q02818 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NUCB1Q02818 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NUCB1Q02818 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NUCB1Q02818 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NUCB1Q02818 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
NUCB1Q02818 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NUCB1Q02818 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NUCB1Q02818 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NUCB1Q02818 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NUCB1Q02818 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NUCB1Q02818 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NUCB1Q02818 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NUCB1Q02818 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
NUCB1Q02818 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NUCB1Q02818 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NUCB1Q02818 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NUCB1Q02818 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NUCB1Q02818 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NUCB1Q02818 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
NUCB1Q02818 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NUCB1Q02818 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NUCB1Q02818 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NUCB1Q02818 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NUCB1Q02818 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NUCB1Q02818 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NUCB1Q02818 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NUCB1Q02818 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NUCB1Q02818 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NUCB1Q02818 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NUCB1Q02818 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NUCB1Q02818 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NUCB1Q02818 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NUCB1Q02818 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NUCB1Q02818 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NUCB1Q02818 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
NUCB1Q02818 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NUCB1Q02818 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NUCB1Q02818 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NUCB1Q02818 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NUCB1Q02818 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NUCB1Q02818 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NUCB1Q02818 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
NUCB1Q02818 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NUCB1Q02818 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms