Protein–RNA interactions for Protein: Q01860

POU5F1, POU domain, class 5, transcription factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POU5F1Q01860 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
POU5F1Q01860 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
POU5F1Q01860 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
POU5F1Q01860 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
POU5F1Q01860 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
POU5F1Q01860 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
POU5F1Q01860 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
POU5F1Q01860 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
POU5F1Q01860 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
POU5F1Q01860 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
POU5F1Q01860 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
POU5F1Q01860 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
POU5F1Q01860 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
POU5F1Q01860 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
POU5F1Q01860 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
POU5F1Q01860 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
POU5F1Q01860 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
POU5F1Q01860 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
POU5F1Q01860 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
POU5F1Q01860 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
POU5F1Q01860 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
POU5F1Q01860 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
POU5F1Q01860 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
POU5F1Q01860 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
POU5F1Q01860 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
POU5F1Q01860 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
POU5F1Q01860 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
POU5F1Q01860 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
POU5F1Q01860 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
POU5F1Q01860 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
POU5F1Q01860 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
POU5F1Q01860 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
POU5F1Q01860 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
POU5F1Q01860 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
POU5F1Q01860 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
POU5F1Q01860 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
POU5F1Q01860 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
POU5F1Q01860 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
POU5F1Q01860 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
POU5F1Q01860 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
POU5F1Q01860 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
POU5F1Q01860 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
POU5F1Q01860 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
POU5F1Q01860 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
POU5F1Q01860 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
POU5F1Q01860 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
POU5F1Q01860 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
POU5F1Q01860 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
POU5F1Q01860 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
POU5F1Q01860 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
POU5F1Q01860 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
POU5F1Q01860 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
POU5F1Q01860 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
POU5F1Q01860 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
POU5F1Q01860 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
POU5F1Q01860 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
POU5F1Q01860 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
POU5F1Q01860 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
POU5F1Q01860 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
POU5F1Q01860 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
POU5F1Q01860 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
POU5F1Q01860 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
POU5F1Q01860 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
POU5F1Q01860 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
POU5F1Q01860 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
POU5F1Q01860 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
POU5F1Q01860 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
POU5F1Q01860 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
POU5F1Q01860 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
POU5F1Q01860 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
POU5F1Q01860 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
POU5F1Q01860 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
POU5F1Q01860 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
POU5F1Q01860 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
POU5F1Q01860 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
POU5F1Q01860 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
POU5F1Q01860 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
POU5F1Q01860 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
POU5F1Q01860 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
POU5F1Q01860 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
POU5F1Q01860 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
POU5F1Q01860 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
POU5F1Q01860 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
POU5F1Q01860 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
POU5F1Q01860 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
POU5F1Q01860 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
POU5F1Q01860 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
POU5F1Q01860 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
POU5F1Q01860 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
POU5F1Q01860 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
POU5F1Q01860 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
POU5F1Q01860 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
POU5F1Q01860 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
POU5F1Q01860 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
POU5F1Q01860 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
POU5F1Q01860 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
POU5F1Q01860 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
POU5F1Q01860 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
POU5F1Q01860 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
POU5F1Q01860 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms