Protein–RNA interactions for Protein: Q01628

IFITM3, Interferon-induced transmembrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM3Q01628 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
IFITM3Q01628 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
IFITM3Q01628 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
IFITM3Q01628 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
IFITM3Q01628 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
IFITM3Q01628 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
IFITM3Q01628 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
IFITM3Q01628 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
IFITM3Q01628 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
IFITM3Q01628 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
IFITM3Q01628 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
IFITM3Q01628 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
IFITM3Q01628 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
IFITM3Q01628 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
IFITM3Q01628 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
IFITM3Q01628 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
IFITM3Q01628 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
IFITM3Q01628 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
IFITM3Q01628 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
IFITM3Q01628 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
IFITM3Q01628 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
IFITM3Q01628 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
IFITM3Q01628 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
IFITM3Q01628 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
IFITM3Q01628 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
IFITM3Q01628 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
IFITM3Q01628 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
IFITM3Q01628 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
IFITM3Q01628 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
IFITM3Q01628 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
IFITM3Q01628 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
IFITM3Q01628 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
IFITM3Q01628 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
IFITM3Q01628 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
IFITM3Q01628 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
IFITM3Q01628 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
IFITM3Q01628 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC14.31□□□□□ -0.12
IFITM3Q01628 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
IFITM3Q01628 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC14.31□□□□□ -0.12
IFITM3Q01628 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC14.31□□□□□ -0.12
IFITM3Q01628 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
IFITM3Q01628 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
IFITM3Q01628 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
IFITM3Q01628 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
IFITM3Q01628 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
IFITM3Q01628 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
IFITM3Q01628 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
IFITM3Q01628 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
IFITM3Q01628 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
IFITM3Q01628 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
IFITM3Q01628 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
IFITM3Q01628 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
IFITM3Q01628 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
IFITM3Q01628 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
IFITM3Q01628 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
IFITM3Q01628 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
IFITM3Q01628 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
IFITM3Q01628 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
IFITM3Q01628 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
IFITM3Q01628 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
IFITM3Q01628 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
IFITM3Q01628 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
IFITM3Q01628 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
IFITM3Q01628 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
IFITM3Q01628 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
IFITM3Q01628 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
IFITM3Q01628 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
IFITM3Q01628 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
IFITM3Q01628 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
IFITM3Q01628 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
IFITM3Q01628 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
IFITM3Q01628 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
IFITM3Q01628 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
IFITM3Q01628 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
IFITM3Q01628 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
IFITM3Q01628 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
IFITM3Q01628 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
IFITM3Q01628 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
IFITM3Q01628 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
IFITM3Q01628 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
IFITM3Q01628 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
IFITM3Q01628 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
IFITM3Q01628 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
IFITM3Q01628 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
IFITM3Q01628 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
IFITM3Q01628 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
IFITM3Q01628 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
IFITM3Q01628 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
IFITM3Q01628 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
IFITM3Q01628 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
IFITM3Q01628 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
IFITM3Q01628 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
IFITM3Q01628 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
IFITM3Q01628 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
IFITM3Q01628 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
IFITM3Q01628 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
IFITM3Q01628 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
IFITM3Q01628 GALC-206ENST00000544807 2528 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
IFITM3Q01628 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
IFITM3Q01628 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms