Protein–RNA interactions for Protein: Q01362

MS4A2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A2Q01362 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
MS4A2Q01362 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MS4A2Q01362 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
MS4A2Q01362 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MS4A2Q01362 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MS4A2Q01362 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MS4A2Q01362 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MS4A2Q01362 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MS4A2Q01362 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MS4A2Q01362 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MS4A2Q01362 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MS4A2Q01362 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MS4A2Q01362 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MS4A2Q01362 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MS4A2Q01362 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MS4A2Q01362 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MS4A2Q01362 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MS4A2Q01362 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
MS4A2Q01362 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MS4A2Q01362 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MS4A2Q01362 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MS4A2Q01362 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MS4A2Q01362 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MS4A2Q01362 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MS4A2Q01362 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MS4A2Q01362 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MS4A2Q01362 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MS4A2Q01362 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
MS4A2Q01362 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MS4A2Q01362 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
MS4A2Q01362 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MS4A2Q01362 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MS4A2Q01362 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MS4A2Q01362 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MS4A2Q01362 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MS4A2Q01362 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MS4A2Q01362 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MS4A2Q01362 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MS4A2Q01362 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MS4A2Q01362 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MS4A2Q01362 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MS4A2Q01362 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MS4A2Q01362 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MS4A2Q01362 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MS4A2Q01362 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MS4A2Q01362 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MS4A2Q01362 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MS4A2Q01362 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MS4A2Q01362 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MS4A2Q01362 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MS4A2Q01362 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
MS4A2Q01362 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MS4A2Q01362 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MS4A2Q01362 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MS4A2Q01362 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MS4A2Q01362 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MS4A2Q01362 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MS4A2Q01362 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
MS4A2Q01362 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MS4A2Q01362 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MS4A2Q01362 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MS4A2Q01362 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MS4A2Q01362 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MS4A2Q01362 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MS4A2Q01362 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MS4A2Q01362 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
MS4A2Q01362 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MS4A2Q01362 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MS4A2Q01362 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MS4A2Q01362 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MS4A2Q01362 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MS4A2Q01362 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MS4A2Q01362 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MS4A2Q01362 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MS4A2Q01362 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MS4A2Q01362 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MS4A2Q01362 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MS4A2Q01362 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MS4A2Q01362 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MS4A2Q01362 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MS4A2Q01362 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MS4A2Q01362 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MS4A2Q01362 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MS4A2Q01362 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MS4A2Q01362 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MS4A2Q01362 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MS4A2Q01362 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MS4A2Q01362 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MS4A2Q01362 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MS4A2Q01362 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MS4A2Q01362 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MS4A2Q01362 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MS4A2Q01362 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MS4A2Q01362 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MS4A2Q01362 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MS4A2Q01362 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MS4A2Q01362 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MS4A2Q01362 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
MS4A2Q01362 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MS4A2Q01362 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.4 ms