Protein–RNA interactions for Protein: Q00978

IRF9, Interferon regulatory factor 9, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF9Q00978 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IRF9Q00978 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IRF9Q00978 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IRF9Q00978 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
IRF9Q00978 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
IRF9Q00978 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
IRF9Q00978 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IRF9Q00978 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IRF9Q00978 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IRF9Q00978 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IRF9Q00978 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IRF9Q00978 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IRF9Q00978 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IRF9Q00978 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IRF9Q00978 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IRF9Q00978 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
IRF9Q00978 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IRF9Q00978 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IRF9Q00978 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IRF9Q00978 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IRF9Q00978 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IRF9Q00978 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IRF9Q00978 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IRF9Q00978 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IRF9Q00978 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
IRF9Q00978 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IRF9Q00978 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IRF9Q00978 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IRF9Q00978 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IRF9Q00978 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IRF9Q00978 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IRF9Q00978 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IRF9Q00978 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IRF9Q00978 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IRF9Q00978 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IRF9Q00978 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IRF9Q00978 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IRF9Q00978 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IRF9Q00978 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IRF9Q00978 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IRF9Q00978 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
IRF9Q00978 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
IRF9Q00978 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IRF9Q00978 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IRF9Q00978 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IRF9Q00978 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IRF9Q00978 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IRF9Q00978 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IRF9Q00978 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
IRF9Q00978 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IRF9Q00978 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IRF9Q00978 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IRF9Q00978 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IRF9Q00978 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IRF9Q00978 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IRF9Q00978 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IRF9Q00978 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IRF9Q00978 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IRF9Q00978 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IRF9Q00978 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IRF9Q00978 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IRF9Q00978 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IRF9Q00978 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IRF9Q00978 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IRF9Q00978 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IRF9Q00978 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IRF9Q00978 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IRF9Q00978 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IRF9Q00978 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IRF9Q00978 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IRF9Q00978 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IRF9Q00978 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IRF9Q00978 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IRF9Q00978 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IRF9Q00978 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
IRF9Q00978 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IRF9Q00978 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IRF9Q00978 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
IRF9Q00978 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IRF9Q00978 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IRF9Q00978 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IRF9Q00978 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IRF9Q00978 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IRF9Q00978 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
IRF9Q00978 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IRF9Q00978 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IRF9Q00978 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IRF9Q00978 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IRF9Q00978 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IRF9Q00978 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IRF9Q00978 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IRF9Q00978 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IRF9Q00978 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IRF9Q00978 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
IRF9Q00978 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IRF9Q00978 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IRF9Q00978 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IRF9Q00978 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IRF9Q00978 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IRF9Q00978 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms