Protein–RNA interactions for Protein: Q00534

CDK6, Cyclin-dependent kinase 6, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK6Q00534 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK6Q00534 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK6Q00534 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK6Q00534 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK6Q00534 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK6Q00534 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK6Q00534 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK6Q00534 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK6Q00534 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK6Q00534 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK6Q00534 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK6Q00534 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK6Q00534 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK6Q00534 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK6Q00534 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK6Q00534 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK6Q00534 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK6Q00534 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK6Q00534 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK6Q00534 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK6Q00534 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK6Q00534 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK6Q00534 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK6Q00534 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK6Q00534 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK6Q00534 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK6Q00534 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK6Q00534 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK6Q00534 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK6Q00534 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK6Q00534 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK6Q00534 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK6Q00534 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK6Q00534 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK6Q00534 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK6Q00534 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK6Q00534 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK6Q00534 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK6Q00534 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK6Q00534 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK6Q00534 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK6Q00534 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK6Q00534 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK6Q00534 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK6Q00534 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK6Q00534 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK6Q00534 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK6Q00534 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK6Q00534 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK6Q00534 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK6Q00534 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK6Q00534 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK6Q00534 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK6Q00534 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK6Q00534 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK6Q00534 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK6Q00534 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK6Q00534 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK6Q00534 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK6Q00534 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK6Q00534 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK6Q00534 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK6Q00534 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK6Q00534 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK6Q00534 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK6Q00534 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK6Q00534 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK6Q00534 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK6Q00534 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK6Q00534 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK6Q00534 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK6Q00534 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK6Q00534 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK6Q00534 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK6Q00534 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK6Q00534 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK6Q00534 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK6Q00534 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK6Q00534 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK6Q00534 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK6Q00534 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK6Q00534 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK6Q00534 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDK6Q00534 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDK6Q00534 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDK6Q00534 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDK6Q00534 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDK6Q00534 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CDK6Q00534 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDK6Q00534 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDK6Q00534 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDK6Q00534 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CDK6Q00534 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDK6Q00534 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDK6Q00534 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDK6Q00534 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDK6Q00534 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDK6Q00534 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDK6Q00534 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDK6Q00534 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms