Protein–RNA interactions for Protein: Q00059

TFAM, Transcription factor A, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAMQ00059 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TFAMQ00059 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TFAMQ00059 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TFAMQ00059 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TFAMQ00059 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TFAMQ00059 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TFAMQ00059 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
TFAMQ00059 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TFAMQ00059 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TFAMQ00059 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TFAMQ00059 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TFAMQ00059 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TFAMQ00059 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TFAMQ00059 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TFAMQ00059 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TFAMQ00059 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TFAMQ00059 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TFAMQ00059 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
TFAMQ00059 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TFAMQ00059 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
TFAMQ00059 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
TFAMQ00059 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
TFAMQ00059 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TFAMQ00059 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TFAMQ00059 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TFAMQ00059 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TFAMQ00059 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TFAMQ00059 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TFAMQ00059 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TFAMQ00059 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TFAMQ00059 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TFAMQ00059 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TFAMQ00059 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TFAMQ00059 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TFAMQ00059 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TFAMQ00059 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TFAMQ00059 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TFAMQ00059 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TFAMQ00059 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TFAMQ00059 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TFAMQ00059 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TFAMQ00059 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TFAMQ00059 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TFAMQ00059 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TFAMQ00059 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TFAMQ00059 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TFAMQ00059 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TFAMQ00059 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TFAMQ00059 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TFAMQ00059 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TFAMQ00059 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TFAMQ00059 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TFAMQ00059 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
TFAMQ00059 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TFAMQ00059 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TFAMQ00059 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TFAMQ00059 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TFAMQ00059 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TFAMQ00059 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TFAMQ00059 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TFAMQ00059 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TFAMQ00059 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TFAMQ00059 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TFAMQ00059 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TFAMQ00059 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TFAMQ00059 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TFAMQ00059 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TFAMQ00059 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TFAMQ00059 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TFAMQ00059 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TFAMQ00059 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TFAMQ00059 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TFAMQ00059 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TFAMQ00059 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TFAMQ00059 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TFAMQ00059 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TFAMQ00059 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TFAMQ00059 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TFAMQ00059 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TFAMQ00059 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TFAMQ00059 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TFAMQ00059 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TFAMQ00059 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TFAMQ00059 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TFAMQ00059 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TFAMQ00059 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TFAMQ00059 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TFAMQ00059 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TFAMQ00059 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TFAMQ00059 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TFAMQ00059 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TFAMQ00059 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TFAMQ00059 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TFAMQ00059 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TFAMQ00059 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TFAMQ00059 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TFAMQ00059 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TFAMQ00059 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TFAMQ00059 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TFAMQ00059 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms