Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
FAM3AP98173 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
FAM3AP98173 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
FAM3AP98173 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
FAM3AP98173 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
FAM3AP98173 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
FAM3AP98173 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC14.35□□□□□ -0.11
FAM3AP98173 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
FAM3AP98173 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
FAM3AP98173 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
FAM3AP98173 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
FAM3AP98173 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
FAM3AP98173 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
FAM3AP98173 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
FAM3AP98173 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
FAM3AP98173 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
FAM3AP98173 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
FAM3AP98173 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
FAM3AP98173 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
FAM3AP98173 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
FAM3AP98173 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
FAM3AP98173 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
FAM3AP98173 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
FAM3AP98173 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
FAM3AP98173 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
FAM3AP98173 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
FAM3AP98173 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
FAM3AP98173 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
FAM3AP98173 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
FAM3AP98173 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
FAM3AP98173 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
FAM3AP98173 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
FAM3AP98173 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
FAM3AP98173 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
FAM3AP98173 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
FAM3AP98173 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
FAM3AP98173 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
FAM3AP98173 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
FAM3AP98173 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
FAM3AP98173 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
FAM3AP98173 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
FAM3AP98173 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
FAM3AP98173 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
FAM3AP98173 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
FAM3AP98173 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
FAM3AP98173 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
FAM3AP98173 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
FAM3AP98173 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
FAM3AP98173 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
FAM3AP98173 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
FAM3AP98173 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
FAM3AP98173 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
FAM3AP98173 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
FAM3AP98173 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
FAM3AP98173 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
FAM3AP98173 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
FAM3AP98173 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
FAM3AP98173 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
FAM3AP98173 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
FAM3AP98173 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
FAM3AP98173 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
FAM3AP98173 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
FAM3AP98173 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
FAM3AP98173 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
FAM3AP98173 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
FAM3AP98173 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
FAM3AP98173 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
FAM3AP98173 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
FAM3AP98173 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
FAM3AP98173 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
FAM3AP98173 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
FAM3AP98173 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
FAM3AP98173 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
FAM3AP98173 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
FAM3AP98173 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
FAM3AP98173 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
FAM3AP98173 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
FAM3AP98173 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
FAM3AP98173 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
FAM3AP98173 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
FAM3AP98173 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
FAM3AP98173 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
FAM3AP98173 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
FAM3AP98173 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.11
FAM3AP98173 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
FAM3AP98173 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
FAM3AP98173 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
FAM3AP98173 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
FAM3AP98173 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
FAM3AP98173 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
FAM3AP98173 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
FAM3AP98173 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
FAM3AP98173 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
FAM3AP98173 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
FAM3AP98173 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
FAM3AP98173 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
FAM3AP98173 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
FAM3AP98173 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
FAM3AP98173 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
FAM3AP98173 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms