Protein–RNA interactions for Protein: P84243

H3F3A, Histone H3.3, humanhuman

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Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3F3AP84243 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
H3F3AP84243 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
H3F3AP84243 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
H3F3AP84243 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
H3F3AP84243 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
H3F3AP84243 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
H3F3AP84243 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
H3F3AP84243 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
H3F3AP84243 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
H3F3AP84243 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
H3F3AP84243 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
H3F3AP84243 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
H3F3AP84243 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
H3F3AP84243 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
H3F3AP84243 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
H3F3AP84243 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
H3F3AP84243 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
H3F3AP84243 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
H3F3AP84243 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
H3F3AP84243 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
H3F3AP84243 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
H3F3AP84243 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
H3F3AP84243 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
H3F3AP84243 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
H3F3AP84243 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
H3F3AP84243 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
H3F3AP84243 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
H3F3AP84243 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
H3F3AP84243 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
H3F3AP84243 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
H3F3AP84243 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
H3F3AP84243 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
H3F3AP84243 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
H3F3AP84243 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
H3F3AP84243 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
H3F3AP84243 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
H3F3AP84243 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
H3F3AP84243 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
H3F3AP84243 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
H3F3AP84243 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
H3F3AP84243 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
H3F3AP84243 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
H3F3AP84243 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
H3F3AP84243 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
H3F3AP84243 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
H3F3AP84243 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
H3F3AP84243 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
H3F3AP84243 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
H3F3AP84243 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
H3F3AP84243 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
H3F3AP84243 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
H3F3AP84243 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
H3F3AP84243 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
H3F3AP84243 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
H3F3AP84243 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
H3F3AP84243 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
H3F3AP84243 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
H3F3AP84243 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
H3F3AP84243 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
H3F3AP84243 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
H3F3AP84243 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
H3F3AP84243 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
H3F3AP84243 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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H3F3AP84243 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
H3F3AP84243 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
H3F3AP84243 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
H3F3AP84243 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
H3F3AP84243 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
H3F3AP84243 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
H3F3AP84243 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
H3F3AP84243 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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H3F3AP84243 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
H3F3AP84243 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
H3F3AP84243 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
H3F3AP84243 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
H3F3AP84243 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
H3F3AP84243 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
H3F3AP84243 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
H3F3AP84243 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
H3F3AP84243 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
H3F3AP84243 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
H3F3AP84243 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
H3F3AP84243 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
H3F3AP84243 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
H3F3AP84243 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
H3F3AP84243 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
H3F3AP84243 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
H3F3AP84243 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
H3F3AP84243 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
H3F3AP84243 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
H3F3AP84243 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
H3F3AP84243 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
H3F3AP84243 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
H3F3AP84243 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
H3F3AP84243 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
H3F3AP84243 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
H3F3AP84243 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
H3F3AP84243 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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