Protein–RNA interactions for Protein: P82279

CRB1, Protein crumbs homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRB1P82279 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CRB1P82279 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CRB1P82279 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CRB1P82279 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CRB1P82279 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CRB1P82279 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CRB1P82279 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CRB1P82279 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CRB1P82279 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CRB1P82279 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CRB1P82279 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CRB1P82279 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CRB1P82279 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CRB1P82279 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CRB1P82279 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CRB1P82279 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CRB1P82279 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CRB1P82279 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CRB1P82279 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CRB1P82279 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CRB1P82279 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CRB1P82279 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CRB1P82279 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CRB1P82279 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CRB1P82279 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CRB1P82279 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CRB1P82279 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CRB1P82279 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CRB1P82279 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CRB1P82279 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CRB1P82279 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CRB1P82279 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CRB1P82279 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CRB1P82279 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CRB1P82279 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CRB1P82279 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CRB1P82279 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CRB1P82279 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CRB1P82279 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CRB1P82279 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CRB1P82279 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CRB1P82279 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CRB1P82279 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CRB1P82279 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CRB1P82279 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CRB1P82279 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CRB1P82279 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CRB1P82279 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CRB1P82279 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CRB1P82279 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CRB1P82279 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CRB1P82279 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CRB1P82279 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CRB1P82279 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CRB1P82279 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CRB1P82279 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CRB1P82279 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CRB1P82279 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CRB1P82279 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CRB1P82279 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CRB1P82279 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CRB1P82279 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CRB1P82279 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CRB1P82279 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CRB1P82279 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CRB1P82279 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CRB1P82279 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CRB1P82279 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CRB1P82279 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CRB1P82279 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CRB1P82279 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CRB1P82279 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CRB1P82279 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CRB1P82279 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CRB1P82279 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CRB1P82279 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CRB1P82279 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CRB1P82279 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CRB1P82279 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CRB1P82279 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CRB1P82279 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CRB1P82279 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CRB1P82279 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CRB1P82279 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CRB1P82279 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CRB1P82279 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CRB1P82279 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CRB1P82279 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CRB1P82279 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CRB1P82279 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CRB1P82279 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CRB1P82279 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CRB1P82279 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CRB1P82279 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CRB1P82279 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CRB1P82279 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CRB1P82279 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CRB1P82279 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CRB1P82279 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CRB1P82279 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms