Protein–RNA interactions for Protein: P61968

LMO4, LIM domain transcription factor LMO4, humanhuman

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Length 165 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO4P61968 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LMO4P61968 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LMO4P61968 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LMO4P61968 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LMO4P61968 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LMO4P61968 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
LMO4P61968 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LMO4P61968 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LMO4P61968 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LMO4P61968 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LMO4P61968 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LMO4P61968 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LMO4P61968 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LMO4P61968 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LMO4P61968 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LMO4P61968 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LMO4P61968 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LMO4P61968 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LMO4P61968 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LMO4P61968 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LMO4P61968 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LMO4P61968 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LMO4P61968 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LMO4P61968 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LMO4P61968 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LMO4P61968 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LMO4P61968 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
LMO4P61968 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
LMO4P61968 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
LMO4P61968 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LMO4P61968 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LMO4P61968 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
LMO4P61968 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
LMO4P61968 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
LMO4P61968 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
LMO4P61968 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
LMO4P61968 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LMO4P61968 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LMO4P61968 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LMO4P61968 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LMO4P61968 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LMO4P61968 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LMO4P61968 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
LMO4P61968 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
LMO4P61968 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.26
LMO4P61968 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
LMO4P61968 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
LMO4P61968 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
LMO4P61968 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
LMO4P61968 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
LMO4P61968 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
LMO4P61968 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
LMO4P61968 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
LMO4P61968 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LMO4P61968 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LMO4P61968 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LMO4P61968 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LMO4P61968 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LMO4P61968 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LMO4P61968 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LMO4P61968 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LMO4P61968 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LMO4P61968 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LMO4P61968 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LMO4P61968 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LMO4P61968 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LMO4P61968 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LMO4P61968 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LMO4P61968 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LMO4P61968 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LMO4P61968 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
LMO4P61968 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LMO4P61968 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LMO4P61968 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LMO4P61968 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LMO4P61968 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LMO4P61968 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
LMO4P61968 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LMO4P61968 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LMO4P61968 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LMO4P61968 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
LMO4P61968 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LMO4P61968 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LMO4P61968 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
LMO4P61968 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
LMO4P61968 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LMO4P61968 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LMO4P61968 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LMO4P61968 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LMO4P61968 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LMO4P61968 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LMO4P61968 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LMO4P61968 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LMO4P61968 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LMO4P61968 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LMO4P61968 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LMO4P61968 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LMO4P61968 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LMO4P61968 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LMO4P61968 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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