Protein–RNA interactions for Protein: P61073

CXCR4, C-X-C chemokine receptor type 4, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCR4P61073 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CXCR4P61073 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CXCR4P61073 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CXCR4P61073 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CXCR4P61073 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CXCR4P61073 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CXCR4P61073 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CXCR4P61073 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CXCR4P61073 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CXCR4P61073 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CXCR4P61073 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CXCR4P61073 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CXCR4P61073 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CXCR4P61073 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CXCR4P61073 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CXCR4P61073 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CXCR4P61073 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CXCR4P61073 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CXCR4P61073 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CXCR4P61073 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CXCR4P61073 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CXCR4P61073 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CXCR4P61073 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
CXCR4P61073 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CXCR4P61073 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CXCR4P61073 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CXCR4P61073 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CXCR4P61073 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CXCR4P61073 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CXCR4P61073 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CXCR4P61073 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CXCR4P61073 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
CXCR4P61073 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CXCR4P61073 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CXCR4P61073 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CXCR4P61073 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CXCR4P61073 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
CXCR4P61073 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CXCR4P61073 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CXCR4P61073 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CXCR4P61073 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CXCR4P61073 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CXCR4P61073 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CXCR4P61073 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CXCR4P61073 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CXCR4P61073 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CXCR4P61073 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CXCR4P61073 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CXCR4P61073 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CXCR4P61073 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CXCR4P61073 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CXCR4P61073 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CXCR4P61073 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CXCR4P61073 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CXCR4P61073 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CXCR4P61073 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CXCR4P61073 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CXCR4P61073 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CXCR4P61073 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CXCR4P61073 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CXCR4P61073 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CXCR4P61073 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CXCR4P61073 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CXCR4P61073 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CXCR4P61073 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CXCR4P61073 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CXCR4P61073 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CXCR4P61073 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CXCR4P61073 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CXCR4P61073 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CXCR4P61073 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CXCR4P61073 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CXCR4P61073 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CXCR4P61073 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CXCR4P61073 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CXCR4P61073 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CXCR4P61073 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
CXCR4P61073 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CXCR4P61073 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CXCR4P61073 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CXCR4P61073 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CXCR4P61073 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CXCR4P61073 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CXCR4P61073 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CXCR4P61073 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CXCR4P61073 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CXCR4P61073 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CXCR4P61073 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CXCR4P61073 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CXCR4P61073 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CXCR4P61073 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CXCR4P61073 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CXCR4P61073 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CXCR4P61073 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CXCR4P61073 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CXCR4P61073 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CXCR4P61073 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CXCR4P61073 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CXCR4P61073 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CXCR4P61073 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms