Protein–RNA interactions for Protein: P55211

CASP9, Caspase-9, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP9P55211 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CASP9P55211 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CASP9P55211 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CASP9P55211 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CASP9P55211 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CASP9P55211 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CASP9P55211 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CASP9P55211 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CASP9P55211 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CASP9P55211 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CASP9P55211 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CASP9P55211 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CASP9P55211 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CASP9P55211 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CASP9P55211 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CASP9P55211 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CASP9P55211 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CASP9P55211 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CASP9P55211 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CASP9P55211 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CASP9P55211 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CASP9P55211 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CASP9P55211 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CASP9P55211 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CASP9P55211 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CASP9P55211 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CASP9P55211 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CASP9P55211 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CASP9P55211 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CASP9P55211 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CASP9P55211 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CASP9P55211 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CASP9P55211 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CASP9P55211 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CASP9P55211 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CASP9P55211 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CASP9P55211 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CASP9P55211 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CASP9P55211 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CASP9P55211 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CASP9P55211 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CASP9P55211 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CASP9P55211 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CASP9P55211 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CASP9P55211 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CASP9P55211 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CASP9P55211 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CASP9P55211 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CASP9P55211 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CASP9P55211 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CASP9P55211 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CASP9P55211 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CASP9P55211 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CASP9P55211 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CASP9P55211 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CASP9P55211 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CASP9P55211 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CASP9P55211 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CASP9P55211 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CASP9P55211 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CASP9P55211 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CASP9P55211 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CASP9P55211 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CASP9P55211 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CASP9P55211 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CASP9P55211 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CASP9P55211 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CASP9P55211 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CASP9P55211 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CASP9P55211 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CASP9P55211 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CASP9P55211 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CASP9P55211 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CASP9P55211 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CASP9P55211 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CASP9P55211 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CASP9P55211 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CASP9P55211 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CASP9P55211 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CASP9P55211 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CASP9P55211 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CASP9P55211 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CASP9P55211 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CASP9P55211 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CASP9P55211 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CASP9P55211 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CASP9P55211 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CASP9P55211 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CASP9P55211 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CASP9P55211 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CASP9P55211 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CASP9P55211 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CASP9P55211 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CASP9P55211 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CASP9P55211 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CASP9P55211 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CASP9P55211 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CASP9P55211 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CASP9P55211 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CASP9P55211 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms