Protein–RNA interactions for Protein: P53602

MVD, Diphosphomevalonate decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MVDP53602 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MVDP53602 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MVDP53602 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MVDP53602 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MVDP53602 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MVDP53602 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MVDP53602 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MVDP53602 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MVDP53602 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MVDP53602 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MVDP53602 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MVDP53602 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MVDP53602 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MVDP53602 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MVDP53602 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MVDP53602 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MVDP53602 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MVDP53602 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MVDP53602 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MVDP53602 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MVDP53602 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MVDP53602 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MVDP53602 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MVDP53602 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MVDP53602 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MVDP53602 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MVDP53602 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MVDP53602 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MVDP53602 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MVDP53602 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MVDP53602 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MVDP53602 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MVDP53602 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MVDP53602 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MVDP53602 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MVDP53602 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MVDP53602 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MVDP53602 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
MVDP53602 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MVDP53602 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MVDP53602 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MVDP53602 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MVDP53602 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MVDP53602 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MVDP53602 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MVDP53602 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MVDP53602 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MVDP53602 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MVDP53602 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MVDP53602 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MVDP53602 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MVDP53602 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MVDP53602 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MVDP53602 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
MVDP53602 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
MVDP53602 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MVDP53602 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
MVDP53602 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MVDP53602 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MVDP53602 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MVDP53602 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MVDP53602 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MVDP53602 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MVDP53602 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MVDP53602 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MVDP53602 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
MVDP53602 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MVDP53602 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
MVDP53602 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MVDP53602 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MVDP53602 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MVDP53602 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MVDP53602 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MVDP53602 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MVDP53602 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MVDP53602 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MVDP53602 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MVDP53602 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MVDP53602 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MVDP53602 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MVDP53602 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MVDP53602 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MVDP53602 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MVDP53602 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MVDP53602 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MVDP53602 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MVDP53602 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MVDP53602 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
MVDP53602 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MVDP53602 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MVDP53602 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MVDP53602 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MVDP53602 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MVDP53602 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MVDP53602 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
MVDP53602 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MVDP53602 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
MVDP53602 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MVDP53602 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MVDP53602 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms